More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2703 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02442  predicted DNA-binding transcriptional regulator  99.5 
 
 		 397 aa  816    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1118  ROK familiy protein  99.5 
 
 		 397 aa  817    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02406  hypothetical protein  99.5 
 
 		 397 aa  816    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2703  ROK family protein  100 
 
 		 397 aa  821    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1127  ROK family protein  98.99 
 
 		 397 aa  814    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2703  ROK family protein  99.24 
 
 		 397 aa  816    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2835  ROK family protein  99.75 
 
 		 397 aa  820    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3783  ROK family protein  99.5 
 
 		 397 aa  818    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4232  ROK family protein  60.35 
 
 		 400 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.492829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  26.01 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  25.77 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.65 
 
 		 383 aa  127  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  28.7 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  25.84 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.89 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  25.8 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  24.79 
 
 		 408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  27.08 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4939  ROK family protein  24.01 
 
 		 419 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  25.43 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  26.01 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  22.92 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  23.16 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.35 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  24.7 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  27.38 
 
 		 388 aa  106  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.3 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  24.59 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  23.32 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.12 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  25.21 
 
 		 407 aa  103  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  28.07 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  23.9 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  22.19 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  24.93 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  25.27 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  25.27 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  27.54 
 
 		 379 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  24.32 
 
 		 406 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  24.32 
 
 		 406 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  24.32 
 
 		 406 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  24.32 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  24.32 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  24.32 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  24.4 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  24.32 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  24.32 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  24.32 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  24.19 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  26.25 
 
 		 391 aa  96.3  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  23.19 
 
 		 400 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  25.28 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  22.89 
 
 		 404 aa  96.3  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  24.38 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  23.12 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  24.29 
 
 		 389 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  26.43 
 
 		 323 aa  94.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  22.62 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  22.44 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  21.43 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  23.12 
 
 		 406 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  23.12 
 
 		 406 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  25.41 
 
 		 399 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  28.44 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  22.35 
 
 		 406 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  23.12 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  23.12 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  27.74 
 
 		 322 aa  93.6  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  27.94 
 
 		 404 aa  93.2  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  24.32 
 
 		 407 aa  93.2  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  27.44 
 
 		 404 aa  93.2  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  28.83 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  24.86 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  22.59 
 
 		 425 aa  92  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  25.9 
 
 		 417 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  24.23 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  24.43 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  22.38 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  27.46 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  30.59 
 
 		 435 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  28.51 
 
 		 322 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  25.91 
 
 		 299 aa  91.3  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  24.18 
 
 		 407 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  25.11 
 
 		 434 aa  90.9  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  23.36 
 
 		 442 aa  90.1  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  28.63 
 
 		 321 aa  90.1  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  30.3 
 
 		 403 aa  90.1  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  28.57 
 
 		 315 aa  90.1  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  21.86 
 
 		 400 aa  89.7  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  23.26 
 
 		 407 aa  89.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4946  ROK family protein  27.41 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  25.29 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  22.47 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  28.4 
 
 		 314 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  25.8 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  29.1 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  22.63 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  25.35 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  23.03 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>