More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3951 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 633 aa  1294    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  58.22 
 
 		 634 aa  739    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  59.35 
 
 		 634 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0273  extracellular solute-binding protein family 5  40.36 
 
 		 630 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000142627  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  39.9 
 
 		 654 aa  435  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1724  extracellular solute-binding protein family 5  40.26 
 
 		 625 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000147125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  38.16 
 
 		 625 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  38 
 
 		 625 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  39.67 
 
 		 620 aa  415  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  38.61 
 
 		 659 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  36.1 
 
 		 619 aa  386  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  38.33 
 
 		 636 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  37.21 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 633 aa  378  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 		 626 aa  339  9e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 579 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  26.79 
 
 		 577 aa  164  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 645 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 636 aa  124  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  25.04 
 
 		 608 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  24.76 
 
 		 572 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 560 aa  107  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  25.23 
 
 		 547 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 559 aa  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  24.77 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 604 aa  100  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 604 aa  100  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.89 
 
 		 552 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  23.38 
 
 		 553 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 576 aa  99.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  25.04 
 
 		 587 aa  95.1  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 		 557 aa  95.1  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  23.7 
 
 		 565 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  25.19 
 
 		 636 aa  92.8  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.44 
 
 		 563 aa  92  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 597 aa  90.5  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 531 aa  88.6  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 		 580 aa  87  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  22.87 
 
 		 627 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  23.91 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 557 aa  86.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.16 
 
 		 609 aa  84.3  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  23.89 
 
 		 609 aa  84.3  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  24.84 
 
 		 522 aa  83.2  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.54 
 
 		 542 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 557 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 522 aa  83.2  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 		 512 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  23.23 
 
 		 567 aa  81.6  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 544 aa  80.5  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 568 aa  77.4  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.31 
 
 		 551 aa  77  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  23.43 
 
 		 576 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 551 aa  75.1  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  25.52 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.59 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.59 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.55 
 
 		 545 aa  73.9  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.2 
 
 		 516 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  28.28 
 
 		 529 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 535 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  24.24 
 
 		 541 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  23.17 
 
 		 675 aa  73.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1271  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.04 
 
 		 528 aa  73.6  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000259921  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  30.49 
 
 		 518 aa  73.2  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  24.62 
 
 		 574 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 532 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 532 aa  72.8  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  23.36 
 
 		 619 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  22.82 
 
 		 537 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  24.62 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  24.62 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 		 561 aa  72  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  24.24 
 
 		 536 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  23.77 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.55 
 
 		 564 aa  71.6  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  23.09 
 
 		 540 aa  71.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  23.77 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  23.77 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2471  putative ABC transporter periplasmic binding protein  28.34 
 
 		 530 aa  71.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  21.36 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  20.78 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  23.76 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.48 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 		 646 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 		 590 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2984  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 508 aa  70.5  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 538 aa  70.5  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4407  twin-arginine translocation pathway signal  24.34 
 
 		 541 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.095613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 		 609 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 530 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>