213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0517 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  100 
 
 		 836 aa  1652    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  79.16 
 
 		 835 aa  1253    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  52.44 
 
 		 749 aa  568  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  32.73 
 
 		 983 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  32.14 
 
 		 1017 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  32.14 
 
 		 991 aa  310  8e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  31.52 
 
 		 844 aa  271  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  31.21 
 
 		 876 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  34 
 
 		 982 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  32.11 
 
 		 830 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  34.4 
 
 		 1079 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  34.33 
 
 		 1078 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  34.19 
 
 		 1078 aa  220  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  33.83 
 
 		 842 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  29.18 
 
 		 837 aa  209  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  27.88 
 
 		 803 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  27.76 
 
 		 819 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  28.28 
 
 		 903 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  26.96 
 
 		 782 aa  154  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  27.23 
 
 		 1040 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  24.75 
 
 		 758 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  28.64 
 
 		 875 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  25.07 
 
 		 765 aa  92  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  25.28 
 
 		 541 aa  92  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  25.57 
 
 		 551 aa  82.4  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  25.55 
 
 		 765 aa  77.4  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  28.73 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  29.14 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  26.17 
 
 		 551 aa  72  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  29.76 
 
 		 293 aa  72  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  25.93 
 
 		 759 aa  71.6  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  29.76 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  22.62 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  27.89 
 
 		 276 aa  69.7  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  29.31 
 
 		 275 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  28.99 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  31.85 
 
 		 287 aa  69.3  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  33.59 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  31.11 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  30 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  31.11 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  31.11 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  34.15 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  27.29 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  29.77 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  30.06 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  28.23 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  31.11 
 
 		 287 aa  67.4  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  28.92 
 
 		 275 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  31.21 
 
 		 326 aa  67  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  28.4 
 
 		 275 aa  67  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  28.16 
 
 		 287 aa  66.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  29.61 
 
 		 277 aa  66.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  22.93 
 
 		 536 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  26.74 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  23.66 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  31.11 
 
 		 288 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  31.11 
 
 		 288 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  31.11 
 
 		 288 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  23.91 
 
 		 516 aa  63.9  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  31.11 
 
 		 288 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  31.11 
 
 		 288 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  30.66 
 
 		 286 aa  63.9  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  31.11 
 
 		 288 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  31.11 
 
 		 275 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  31.11 
 
 		 288 aa  63.9  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  31.11 
 
 		 288 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  31.11 
 
 		 288 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  25.37 
 
 		 533 aa  63.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  32 
 
 		 304 aa  63.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  33.6 
 
 		 289 aa  62.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  31.25 
 
 		 279 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  28.89 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  28.89 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  29.41 
 
 		 757 aa  62.4  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  26.26 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  30.08 
 
 		 288 aa  62  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  32.48 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  28.24 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  31.11 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  23.37 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  31.11 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  31.11 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  31.97 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  31.11 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  31.11 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  29.93 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  29.93 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  28 
 
 		 295 aa  60.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  22.78 
 
 		 508 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  29.81 
 
 		 307 aa  60.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  33.61 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  28.51 
 
 		 349 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  25.12 
 
 		 308 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  25.12 
 
 		 308 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  24.38 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  25.69 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  32.8 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  25.85 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  28.66 
 
 		 753 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>