125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3744 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  56.65 
 
 		 819 aa  740    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  84.85 
 
 		 825 aa  1254    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  100 
 
 		 826 aa  1608    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  50.18 
 
 		 820 aa  681    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  76.59 
 
 		 815 aa  1051    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  51.03 
 
 		 821 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  51.33 
 
 		 821 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  50.55 
 
 		 821 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  50.91 
 
 		 819 aa  696    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  49.82 
 
 		 820 aa  669    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  56.76 
 
 		 819 aa  748    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  57.02 
 
 		 820 aa  751    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  55.98 
 
 		 819 aa  676    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  49.94 
 
 		 821 aa  690    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  42.96 
 
 		 800 aa  532  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  49.7 
 
 		 795 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  44.43 
 
 		 793 aa  523  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  46.68 
 
 		 800 aa  524  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  49.02 
 
 		 795 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  49.02 
 
 		 795 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  45.41 
 
 		 802 aa  509  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  40.25 
 
 		 804 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  32.13 
 
 		 817 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  30.71 
 
 		 817 aa  321  3.9999999999999996e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  30.27 
 
 		 817 aa  320  7e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  32.42 
 
 		 836 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  30.44 
 
 		 889 aa  290  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  30.31 
 
 		 884 aa  286  9e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  29.83 
 
 		 879 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  29.94 
 
 		 889 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  30.42 
 
 		 840 aa  281  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  30.84 
 
 		 887 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  30.77 
 
 		 887 aa  272  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  29.08 
 
 		 865 aa  271  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  31.13 
 
 		 889 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  30.63 
 
 		 836 aa  262  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  31.44 
 
 		 850 aa  262  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  30.56 
 
 		 836 aa  262  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  31.14 
 
 		 849 aa  262  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  29.98 
 
 		 878 aa  261  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  29.55 
 
 		 897 aa  259  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  28.6 
 
 		 849 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  29.63 
 
 		 845 aa  234  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  29.11 
 
 		 850 aa  225  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  26.64 
 
 		 847 aa  211  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 		 845 aa  207  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 		 847 aa  207  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  26.95 
 
 		 803 aa  206  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.79 
 
 		 855 aa  202  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  27.22 
 
 		 839 aa  193  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.77 
 
 		 866 aa  180  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.77 
 
 		 870 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  29.02 
 
 		 843 aa  174  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  25.06 
 
 		 813 aa  174  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 		 837 aa  169  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  28.33 
 
 		 753 aa  124  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  30.81 
 
 		 872 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  26.91 
 
 		 929 aa  117  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  31.34 
 
 		 843 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.01 
 
 		 858 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  30.47 
 
 		 846 aa  114  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  24.85 
 
 		 858 aa  107  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  22.34 
 
 		 855 aa  97.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  24.61 
 
 		 884 aa  95.1  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 		 849 aa  92  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  21.71 
 
 		 851 aa  88.6  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  24.19 
 
 		 849 aa  88.6  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  24.44 
 
 		 846 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 		 877 aa  86.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  26.65 
 
 		 877 aa  85.5  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 857 aa  84.3  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  23 
 
 		 850 aa  84  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  23.36 
 
 		 844 aa  80.9  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  25.24 
 
 		 867 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  23.76 
 
 		 857 aa  80.9  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  27.88 
 
 		 842 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  24.01 
 
 		 866 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 		 842 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  28.13 
 
 		 842 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  23.35 
 
 		 855 aa  62  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  25.16 
 
 		 841 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  21.78 
 
 		 843 aa  55.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  25 
 
 		 868 aa  54.7  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  25.78 
 
 		 853 aa  53.9  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  24.19 
 
 		 856 aa  52.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3857  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.42 
 
 		 414 aa  52  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  24.87 
 
 		 399 aa  51.6  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  21.49 
 
 		 847 aa  52  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003992  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  22.93 
 
 		 374 aa  51.2  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  23.94 
 
 		 379 aa  50.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  19.42 
 
 		 858 aa  50.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  23.53 
 
 		 416 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 		 379 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  26.09 
 
 		 841 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  23.12 
 
 		 416 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1446  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.51 
 
 		 417 aa  48.9  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  21.65 
 
 		 834 aa  48.5  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  20.29 
 
 		 376 aa  48.5  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  22.89 
 
 		 841 aa  48.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>