More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2553 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  100 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  81.57 
 
 		 221 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  81.57 
 
 		 221 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  81.11 
 
 		 221 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  69.91 
 
 		 222 aa  286  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  69.44 
 
 		 222 aa  284  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  69.44 
 
 		 217 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  66.2 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.04 
 
 		 218 aa  260  8.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  67.59 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  67.13 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  61.75 
 
 		 217 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  65.28 
 
 		 229 aa  254  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  62.67 
 
 		 255 aa  250  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  58.8 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  60.19 
 
 		 218 aa  248  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  61.75 
 
 		 227 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  62.21 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  59.72 
 
 		 236 aa  237  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  62.15 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  58.26 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  54.46 
 
 		 220 aa  205  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  48.36 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  48.36 
 
 		 236 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  48.36 
 
 		 236 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  48.36 
 
 		 236 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  47.62 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  48.57 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  48.57 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  48.1 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  47.93 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  47.91 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  45.07 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  44.78 
 
 		 243 aa  181  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  43.32 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  47.25 
 
 		 222 aa  181  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.87 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  46.33 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.37 
 
 		 245 aa  178  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.2 
 
 		 255 aa  177  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  45.93 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  46.95 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  43.87 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  42.4 
 
 		 244 aa  175  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  47.69 
 
 		 245 aa  175  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  48.13 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  45.75 
 
 		 271 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  45.66 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  38.36 
 
 		 226 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  43.98 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  45.02 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  43.13 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  41.1 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  42.73 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  44.81 
 
 		 263 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.04 
 
 		 280 aa  172  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  49.26 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  45.83 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  47.37 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  46.53 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  45.16 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  47.49 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  39.35 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  44.55 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  45.62 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  40.55 
 
 		 247 aa  170  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  44.55 
 
 		 455 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  45.16 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 291 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01332  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  42.59 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  43.2 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  41.2 
 
 		 250 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.13 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  39.37 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  49.3 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  47.32 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  45.62 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  44.24 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 233 aa  168  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.33 
 
 		 233 aa  168  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  46.26 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  42.59 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  45.07 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001050  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 221 aa  167  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 233 aa  167  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  44.08 
 
 		 445 aa  167  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  42.59 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3459  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 258 aa  167  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  39.27 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  47.09 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>