More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1039 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 189 aa  72  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 98 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  29.17 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  27.33 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1240  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  28.77 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  28.77 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  25 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  24.28 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>