237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2356 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 410 aa  774    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  54.32 
 
 		 410 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  42.57 
 
 		 413 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  40.8 
 
 		 408 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  33.01 
 
 		 918 aa  189  7e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  30.65 
 
 		 1050 aa  189  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  32.91 
 
 		 834 aa  184  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  26.97 
 
 		 605 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04131  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  29.21 
 
 		 698 aa  143  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.966823  normal  0.103258 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05035  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  29.2 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  32.25 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  26.47 
 
 		 413 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  30.13 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  29.98 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.07 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 		 449 aa  107  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  26.85 
 
 		 436 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  27.77 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  30.6 
 
 		 448 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  29.38 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 		 413 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 		 413 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  30.94 
 
 		 454 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  31.48 
 
 		 454 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  31.42 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  26.47 
 
 		 437 aa  86.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  29.09 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  26.34 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  32.33 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  29.36 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  30.49 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  31.1 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  27.82 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  29.63 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  31.55 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  30.74 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.76 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 		 741 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  32.67 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.25 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01920  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  25.45 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.017465 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.27 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  28.54 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  27.6 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  33.75 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.59 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  27.93 
 
 		 597 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  27.49 
 
 		 597 aa  67.4  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  34.95 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  28.66 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  27.95 
 
 		 622 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  25.61 
 
 		 569 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  27.95 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  27.95 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.71 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  29.71 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.71 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0109  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  25.52 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000142574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  24.91 
 
 		 626 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.67 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  27.5 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.8 
 
 		 669 aa  60.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  31.63 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.15 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  26.15 
 
 		 581 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  30.67 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  26.95 
 
 		 598 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 610 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  28.57 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  27.67 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  21.82 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  27.33 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  26.34 
 
 		 444 aa  57  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  26.47 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>