277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0166 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0166  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 390 aa  795    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  39.71 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  43.08 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  43.08 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  44.93 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  42.42 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  38.24 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  38.81 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  38.81 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  38.24 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  38.81 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  38.24 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  42.62 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  38.24 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  38.27 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  38.24 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  38.24 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  38.24 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  38.81 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  41.18 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  35.8 
 
 		 502 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  37.31 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.79 
 
 		 486 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  37.31 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  37.31 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  37.68 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  42.86 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.27 
 
 		 506 aa  56.2  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  39.71 
 
 		 487 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  35 
 
 		 493 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  37.04 
 
 		 507 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  35.94 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  41.54 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  40 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  42.86 
 
 		 489 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  36.27 
 
 		 535 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  34.09 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  41.27 
 
 		 511 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  43.1 
 
 		 474 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  36.36 
 
 		 514 aa  53.9  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  37.5 
 
 		 361 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.09 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  38.46 
 
 		 504 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  43.75 
 
 		 481 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  38.33 
 
 		 474 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  42.19 
 
 		 673 aa  52.4  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  43.55 
 
 		 527 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  39.06 
 
 		 505 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  43.55 
 
 		 527 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  40.32 
 
 		 516 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  36.76 
 
 		 478 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  44.83 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  38.81 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  38.81 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  38.81 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  37.31 
 
 		 450 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  34.78 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  42.37 
 
 		 464 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  32.5 
 
 		 518 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  39.06 
 
 		 509 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  41.38 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  34.09 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  39.39 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  34.78 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  43.75 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  38.71 
 
 		 528 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  31.82 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  40.62 
 
 		 489 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  37.5 
 
 		 503 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  38.46 
 
 		 488 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  41.27 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  35.94 
 
 		 503 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  37.18 
 
 		 466 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  35.8 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  38.81 
 
 		 451 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  40.74 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.66 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1761  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.77 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.71 
 
 		 495 aa  50.4  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  34.38 
 
 		 493 aa  50.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  29.69 
 
 		 501 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2913  2-alkenal reductase  41.67 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108818  normal  0.221837 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.33 
 
 		 408 aa  50.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  34.38 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3167  DEAD/DEAH box helicase-like  38.82 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  42.19 
 
 		 377 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1037  serine protease  42.19 
 
 		 373 aa  49.7  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0643787  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  33.64 
 
 		 483 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  34.92 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  33.64 
 
 		 483 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  40 
 
 		 477 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  36.07 
 
 		 504 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.18 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  40.62 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  34.38 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  34.38 
 
 		 476 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  39.66 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  38.98 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  39.68 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>