More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2378 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 151 aa  310  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  53.15 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3975  hypothetical protein  53.28 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.123478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1859  endoribonuclease L-PSP  52.55 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  43.7 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3905  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 164 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0995322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  36.43 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  32.61 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  34.27 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3553  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  32.81 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  31.75 
 
 		 402 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 394 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  30.88 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  30.23 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  30.4 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  30.77 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  26.71 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  32.85 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  29.71 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  33.56 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  29.79 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  32.09 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0674  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.892091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  32.62 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  28.68 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  28.68 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  27.46 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  31.01 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4880  Endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  32.8 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  28.89 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  30.66 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  28.36 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  29.58 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  33.06 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  28.38 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  32.39 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>