94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2522 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  559  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  55.06 
 
 		 267 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  55.06 
 
 		 262 aa  312  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  56.08 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  52.24 
 
 		 260 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  46.24 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  44.89 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  53.57 
 
 		 199 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  40.71 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  40.93 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  37.08 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  45.56 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  42.86 
 
 		 355 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  38.31 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  38.22 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  35.94 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  36.4 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2211  NERD domain-containing protein  44.14 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  41.11 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  36.05 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1610  hypothetical protein  32.96 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00290154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  40.96 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  51.92 
 
 		 212 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  51.92 
 
 		 212 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1889  hypothetical protein  41.74 
 
 		 139 aa  89  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.344159 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1109  hypothetical protein  30.3 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1416  NERD domain-containing protein  28.25 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07440  hypothetical protein  41.24 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316107  normal  0.202998 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0503  NERD domain-containing protein  27.44 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.180514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  27.57 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2103  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  41.1 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0334  NERD domain-containing protein  27.88 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0988306  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2098  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  59.46 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0131  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  62.16 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.290593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  34.18 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  54.35 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2536  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  40.28 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0364956  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1210  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  54.05 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.329141  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  36.05 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  47.17 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  55.88 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  44.44 
 
 		 739 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  48.65 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3513  NERD domain-containing protein  31.03 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2594  NERD domain protein  25.17 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.173089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  58.82 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4962  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  54.55 
 
 		 154 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.583488  normal  0.69553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  29.17 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  29.17 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  24.71 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  41.67 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3449  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  44.19 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  50 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  52.78 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  51.43 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  38.98 
 
 		 798 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  42.55 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  52.94 
 
 		 744 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6548  NERD domain-containing protein  26.75 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5568  NERD domain-containing protein  26.92 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.539565 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  38.33 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  55.88 
 
 		 313 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  38.33 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  47.73 
 
 		 765 aa  46.2  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5222  hypothetical protein  22.41 
 
 		 320 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  51.52 
 
 		 708 aa  45.8  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4947  hypothetical protein  22.41 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  41.38 
 
 		 802 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  21.45 
 
 		 853 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5325  hypothetical protein  22.41 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf298  DNA topoisomerase I  38.3 
 
 		 620 aa  45.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.504202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3685  NERD domain-containing protein  31.25 
 
 		 353 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  30.69 
 
 		 700 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  38.98 
 
 		 798 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2529  DNA topoisomerase III  48.65 
 
 		 722 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  36 
 
 		 696 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  29.51 
 
 		 694 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  45.95 
 
 		 440 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  37.29 
 
 		 798 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  47.06 
 
 		 730 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  43.75 
 
 		 799 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  38 
 
 		 700 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  45.95 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 747 aa  43.5  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  48.57 
 
 		 710 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  22.17 
 
 		 760 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3657  NERD domain-containing protein  30.21 
 
 		 351 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.779126  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  46.88 
 
 		 715 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1888  hypothetical protein  33.87 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.349997 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  39.58 
 
 		 804 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  31.25 
 
 		 768 aa  42.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5243  nerd domain protein  27.34 
 
 		 319 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  22.97 
 
 		 751 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  37.5 
 
 		 798 aa  42  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>