More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2679 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  100 
 
 		 627 aa  1238    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  44.81 
 
 		 627 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  45 
 
 		 607 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  45.17 
 
 		 607 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  40.78 
 
 		 598 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  37.44 
 
 		 610 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  36.94 
 
 		 594 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  38.95 
 
 		 671 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  38.28 
 
 		 639 aa  333  6e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  38.11 
 
 		 639 aa  332  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  35.19 
 
 		 643 aa  329  8e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  32.13 
 
 		 653 aa  302  1e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  31.74 
 
 		 622 aa  264  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  31.63 
 
 		 622 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  31.91 
 
 		 620 aa  246  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  32.72 
 
 		 637 aa  240  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  29.42 
 
 		 665 aa  223  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  30.05 
 
 		 653 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  30.31 
 
 		 663 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  28.28 
 
 		 661 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  28.13 
 
 		 661 aa  213  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  29.48 
 
 		 653 aa  209  9e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  28.28 
 
 		 661 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  27.18 
 
 		 588 aa  206  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  30.85 
 
 		 632 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  28.31 
 
 		 652 aa  194  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  27.87 
 
 		 677 aa  192  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  27.82 
 
 		 595 aa  185  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  26.53 
 
 		 674 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  29.04 
 
 		 647 aa  177  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  27.85 
 
 		 615 aa  169  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  29.07 
 
 		 776 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  27.19 
 
 		 595 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  28.37 
 
 		 709 aa  158  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  24.48 
 
 		 593 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  24.72 
 
 		 702 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  25.97 
 
 		 789 aa  150  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  25.77 
 
 		 613 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  26.28 
 
 		 633 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  25.59 
 
 		 670 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  27.75 
 
 		 779 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  24.95 
 
 		 571 aa  123  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  22.26 
 
 		 583 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  22.09 
 
 		 583 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  22.09 
 
 		 580 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  26.35 
 
 		 610 aa  105  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  24.91 
 
 		 578 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  23.63 
 
 		 607 aa  101  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2883  surface antigen (D15)  26.01 
 
 		 634 aa  101  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  22.08 
 
 		 575 aa  100  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3560  surface antigen (D15)  25.83 
 
 		 634 aa  99.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  24.31 
 
 		 582 aa  99.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  23.91 
 
 		 555 aa  99.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  24.59 
 
 		 577 aa  98.2  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3955  surface antigen (D15)  24.96 
 
 		 629 aa  94.7  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98923  normal  0.366661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  21.75 
 
 		 583 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  24.41 
 
 		 579 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  24.47 
 
 		 835 aa  94.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  24.52 
 
 		 579 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  25.22 
 
 		 585 aa  92.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  25.68 
 
 		 573 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  25.55 
 
 		 618 aa  91.3  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  23.2 
 
 		 593 aa  90.9  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  23.78 
 
 		 577 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  22.64 
 
 		 575 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  24.15 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  23.52 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  24.15 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  23.52 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  24.4 
 
 		 657 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  23.52 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  23.52 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  24.15 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  23.52 
 
 		 577 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  23.52 
 
 		 577 aa  89  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  23.52 
 
 		 577 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  24.15 
 
 		 577 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  24.15 
 
 		 577 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  23.52 
 
 		 577 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  24.87 
 
 		 677 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  25.29 
 
 		 573 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  25.29 
 
 		 573 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  25.29 
 
 		 573 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  25.27 
 
 		 605 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  25.29 
 
 		 571 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  24.61 
 
 		 677 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  23.73 
 
 		 781 aa  85.9  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  25.29 
 
 		 605 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  25.27 
 
 		 605 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  26.38 
 
 		 558 aa  84.7  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  25.27 
 
 		 605 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  26.08 
 
 		 601 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  23.92 
 
 		 591 aa  84.3  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  24.57 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  23.35 
 
 		 571 aa  81.6  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1658  surface antigen (D15)  23.63 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.586851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  23.35 
 
 		 571 aa  81.6  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  24.51 
 
 		 682 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  23.94 
 
 		 611 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  26.11 
 
 		 820 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>