95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3069 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 391 aa  813    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1566  UDP-galactopyranose mutase  53.02 
 
 		 382 aa  451  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00174985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3214  UDP-galactopyranose mutase  53.42 
 
 		 386 aa  441  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  48.95 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2744  UDP-galactopyranose mutase  47.52 
 
 		 373 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  42.71 
 
 		 404 aa  347  3e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  43.38 
 
 		 814 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0647  UDP-galactopyranose mutase  44.62 
 
 		 400 aa  340  2e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000447576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  42.45 
 
 		 373 aa  337  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  42.97 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  42.04 
 
 		 372 aa  329  5.0000000000000004e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  43.34 
 
 		 390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0516  UDP-galactopyranose mutase  42.26 
 
 		 383 aa  327  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0049322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1194  UDP-galactopyranose mutase  43.52 
 
 		 379 aa  325  9e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.886744  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  42.56 
 
 		 369 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  41.65 
 
 		 370 aa  318  7e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  42.45 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1305  UDP-galactopyranose mutase  42.82 
 
 		 377 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2702  UDP-galactopyranose mutase  41.34 
 
 		 393 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601095  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  42.53 
 
 		 376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  41.04 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  42.93 
 
 		 376 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  42.22 
 
 		 363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  42.08 
 
 		 783 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  38.62 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  40.81 
 
 		 783 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  40.76 
 
 		 369 aa  288  8e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01310  UDP-galactopyranose mutase  36.99 
 
 		 415 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.915549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08860  UDP-galactopyranose mutase  36.79 
 
 		 395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.271109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4319  UDP-galactopyranose mutase  36.92 
 
 		 395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.591076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2424  UDP-galactopyranose mutase  35.49 
 
 		 409 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0628072 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  38.3 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  39.05 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  39.15 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0128  UDP-galactopyranose mutase  36.62 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1171  UDP-galactopyranose mutase  35.4 
 
 		 395 aa  252  7e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0707003  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2694  UDP-galactopyranose mutase  35.66 
 
 		 395 aa  252  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42371  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42228  predicted protein  37.44 
 
 		 460 aa  252  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0635  UDP-galactopyranose mutase  36.15 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2575  UDP-galactopyranose mutase  35.75 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  36.05 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1159  UDP-galactopyranose mutase  35.19 
 
 		 425 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183925  normal  0.0936925 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2533  UDP-galactopyranose mutase  36.29 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  36.2 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5401  UDP-galactopyranose mutase  33.92 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5108  UDP-galactopyranose mutase  33.92 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.302478 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  35.98 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5020  UDP-galactopyranose mutase  33.92 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13843  UDP-galactopyranose mutase glf  34.67 
 
 		 399 aa  239  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  36.46 
 
 		 368 aa  239  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5650  UDP-galactopyranose mutase  34.26 
 
 		 413 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463461  normal  0.994274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0161  UDP-galactopyranose mutase  34.77 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  36.65 
 
 		 370 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4114  predicted protein  36.36 
 
 		 391 aa  235  8e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.718701  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20850  UDP-galactopyranose mutase  34.1 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1401  UDP-galactopyranose mutase  33.16 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  34.75 
 
 		 365 aa  233  6e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3888  UDP-galactopyranose mutase  33.59 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  34.03 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0204  UDP-galactopyranose mutase  34.6 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255316  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  36.22 
 
 		 381 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  34.86 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  33.16 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14770  UDP-galactopyranose mutase  32.98 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  33.94 
 
 		 383 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  33.68 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  33.68 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  31.96 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4186  UDP-galactopyranose mutase  33.59 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08330  UDP-galactopyranose mutase  33.42 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0799137  normal  0.20676 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  33.59 
 
 		 383 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  32.14 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  32.91 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3019  UDP-galactopyranose mutase  34.46 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  33.16 
 
 		 391 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  31.2 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  32.81 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1179  UDP-galactopyranose mutase  29.24 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  23.6 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  53.06 
 
 		 245 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  53.06 
 
 		 484 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  22.35 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  48.33 
 
 		 476 aa  50.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  25.4 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 443 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  36.99 
 
 		 492 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  20.46 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  30.77 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  24.86 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  30.08 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  22.93 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4610  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  27.52 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3063  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.91 
 
 		 559 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.924929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>