75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03301 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  100 
 
 		 376 aa  770    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  67.27 
 
 		 333 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  61.73 
 
 		 347 aa  425  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  56.88 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  55.94 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  50.16 
 
 		 420 aa  299  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  45.74 
 
 		 349 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  44.95 
 
 		 349 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  48.38 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  45.86 
 
 		 635 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  48.25 
 
 		 709 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  42.12 
 
 		 336 aa  258  9e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  42.25 
 
 		 556 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  40.26 
 
 		 340 aa  223  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  38.34 
 
 		 326 aa  202  9e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  37.29 
 
 		 334 aa  199  7e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  33.22 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  30.96 
 
 		 749 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 814 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  26.22 
 
 		 831 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  30.7 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  28.94 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  30.57 
 
 		 1194 aa  68.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  24.75 
 
 		 869 aa  66.2  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  26.26 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  27.8 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 814 aa  63.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  33.88 
 
 		 717 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  19.54 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  33.11 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  27.98 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  26.18 
 
 		 525 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  29.85 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  19.74 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  26.9 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  23.42 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  30 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  23.24 
 
 		 566 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 		 584 aa  53.1  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  24.89 
 
 		 561 aa  53.1  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  25.9 
 
 		 847 aa  53.1  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  25.56 
 
 		 572 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  22.92 
 
 		 705 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 		 362 aa  49.7  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  23.57 
 
 		 900 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  21.23 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  25.11 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.02 
 
 		 507 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  23.29 
 
 		 562 aa  47.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 		 365 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  23.12 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  29.58 
 
 		 743 aa  46.6  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  25.34 
 
 		 516 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  22.79 
 
 		 593 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  23.62 
 
 		 533 aa  46.2  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  22.28 
 
 		 853 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  24.32 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  28.79 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  26.09 
 
 		 681 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  23.71 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  28.11 
 
 		 523 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  25.54 
 
 		 460 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  28.32 
 
 		 1115 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  19.65 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  32.41 
 
 		 630 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  22.67 
 
 		 501 aa  43.5  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  24.44 
 
 		 621 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  23.73 
 
 		 566 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  29.17 
 
 		 485 aa  43.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  22.92 
 
 		 551 aa  43.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  23.76 
 
 		 403 aa  43.1  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 		 377 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  28.97 
 
 		 475 aa  42.7  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>