288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02060 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02060  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  96.6 
 
 		 920 aa  287  8e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  96.6 
 
 		 920 aa  286  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  98.13 
 
 		 849 aa  216  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  62.07 
 
 		 918 aa  185  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  57.24 
 
 		 947 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  59.31 
 
 		 942 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  58.62 
 
 		 946 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  57.93 
 
 		 946 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  57.93 
 
 		 946 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  55.86 
 
 		 927 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  48 
 
 		 933 aa  151  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  42.76 
 
 		 911 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  40.69 
 
 		 898 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04256  hypothetical protein  38.89 
 
 		 328 aa  94.4  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  35.85 
 
 		 851 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  39.46 
 
 		 853 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  38.36 
 
 		 847 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  35.62 
 
 		 613 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  39.23 
 
 		 906 aa  85.5  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  38.93 
 
 		 1094 aa  85.5  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  34.93 
 
 		 618 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  39.23 
 
 		 906 aa  85.1  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  36.55 
 
 		 661 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  36.55 
 
 		 661 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  36.55 
 
 		 661 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  39.46 
 
 		 979 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  36.55 
 
 		 661 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  36.55 
 
 		 661 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  36.55 
 
 		 661 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  36.55 
 
 		 661 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  37.59 
 
 		 777 aa  82.4  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  38.78 
 
 		 928 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  36.84 
 
 		 796 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  36.55 
 
 		 661 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  35.17 
 
 		 748 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  37.24 
 
 		 875 aa  78.6  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  37.98 
 
 		 871 aa  78.2  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  36.81 
 
 		 1111 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  36.81 
 
 		 1111 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  36.43 
 
 		 869 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  38.64 
 
 		 703 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  36.05 
 
 		 895 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  37.3 
 
 		 907 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  32.64 
 
 		 614 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  38.3 
 
 		 790 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  36.84 
 
 		 687 aa  72.8  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  35.1 
 
 		 741 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  34.11 
 
 		 618 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  37.84 
 
 		 962 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  37.84 
 
 		 1006 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02053  putative VGR-related protein  92.11 
 
 		 69 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.483238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  35.42 
 
 		 1111 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  35.61 
 
 		 850 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  35.61 
 
 		 850 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  35.61 
 
 		 850 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  35.71 
 
 		 885 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  36.3 
 
 		 1111 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  39.5 
 
 		 932 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  40.34 
 
 		 935 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  40.34 
 
 		 935 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  34.92 
 
 		 865 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  40.34 
 
 		 935 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  40.34 
 
 		 935 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  40.34 
 
 		 935 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  40.34 
 
 		 935 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  40.34 
 
 		 935 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  37.01 
 
 		 855 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  33.07 
 
 		 958 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  42.11 
 
 		 984 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  34.38 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  30.26 
 
 		 683 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  34.38 
 
 		 754 aa  66.6  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  33.77 
 
 		 741 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 890 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  33.86 
 
 		 762 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2009  Rhs element Vgr protein  33.86 
 
 		 762 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  33.86 
 
 		 762 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  33.86 
 
 		 762 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  33.86 
 
 		 762 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0740  Rhs element Vgr protein  33.86 
 
 		 762 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  33.86 
 
 		 762 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  34 
 
 		 689 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  29.61 
 
 		 683 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  34.88 
 
 		 688 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 		 834 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 		 834 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  34 
 
 		 689 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  34.88 
 
 		 808 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  35.2 
 
 		 834 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  36.96 
 
 		 767 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  33.86 
 
 		 763 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  34.38 
 
 		 852 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  35.51 
 
 		 767 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  31.75 
 
 		 910 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  33.86 
 
 		 763 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  33.86 
 
 		 763 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  31.41 
 
 		 730 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  27.7 
 
 		 779 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  32.67 
 
 		 643 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>