More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0667 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  607  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  93.73 
 
 		 303 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  41.06 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1156  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  41.06 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  40.89 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0758  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0306  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 315 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0789  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 315 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2593  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3879  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0667  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0690  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 316 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  37.91 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 340 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  33.66 
 
 		 284 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5170  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.268842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  32.68 
 
 		 284 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6295  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3951  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.254801 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 284 aa  149  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.46 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  30.46 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4448  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 284 aa  146  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3957  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0264307 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7057  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  32.47 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  33.76 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 313 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  33.33 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 359 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  32.21 
 
 		 292 aa  133  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  29.37 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 318 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  33.11 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1900  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00385171  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  32.9 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.72 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2927  putative transcriptional regulator  31.44 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 295 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 318 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34450  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000710752  normal  0.295536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 320 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 334 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 214 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  32.22 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>