More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1011 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  100 
 
 		 583 aa  1154    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  70.6 
 
 		 587 aa  800    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  66.67 
 
 		 587 aa  711    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  67.59 
 
 		 584 aa  735    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  97.77 
 
 		 583 aa  1108    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  66.49 
 
 		 589 aa  695    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  52.74 
 
 		 577 aa  561  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  48.71 
 
 		 603 aa  546  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  34 
 
 		 599 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  35.86 
 
 		 575 aa  311  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  34.15 
 
 		 587 aa  298  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  36.76 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  33.1 
 
 		 586 aa  289  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  33.57 
 
 		 587 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  32.83 
 
 		 588 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  32.98 
 
 		 588 aa  280  7e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  32.19 
 
 		 585 aa  278  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  32.48 
 
 		 587 aa  266  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  28.12 
 
 		 538 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  27.94 
 
 		 596 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  28.31 
 
 		 596 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  26.97 
 
 		 625 aa  134  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  24.44 
 
 		 625 aa  131  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  27.79 
 
 		 609 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  25.83 
 
 		 593 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  24.38 
 
 		 529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  25.46 
 
 		 597 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  27.07 
 
 		 594 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  29.89 
 
 		 592 aa  110  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.32 
 
 		 565 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  25.94 
 
 		 551 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.54 
 
 		 483 aa  107  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  27.59 
 
 		 523 aa  107  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  27.77 
 
 		 509 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.01 
 
 		 533 aa  102  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.64 
 
 		 526 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  28.61 
 
 		 461 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  26.07 
 
 		 527 aa  100  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1660  Na+/solute symporter  28.01 
 
 		 489 aa  99.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139174  normal  0.613212 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  29.3 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.19 
 
 		 567 aa  97.1  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.78 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.65 
 
 		 522 aa  94.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.3 
 
 		 520 aa  94  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  28.35 
 
 		 461 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  27.04 
 
 		 520 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  28.82 
 
 		 498 aa  91.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  25.75 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.32 
 
 		 520 aa  91.3  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.1 
 
 		 484 aa  90.5  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  28.18 
 
 		 460 aa  90.5  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  25.4 
 
 		 509 aa  89.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.68 
 
 		 519 aa  90.1  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  26.94 
 
 		 551 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  23.34 
 
 		 556 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.75 
 
 		 500 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.19 
 
 		 522 aa  87.4  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.48 
 
 		 487 aa  87  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  28.72 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.52 
 
 		 526 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.76 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.75 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  24.76 
 
 		 604 aa  84.3  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  25.9 
 
 		 562 aa  84  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  26.07 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  23.61 
 
 		 492 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  23.87 
 
 		 527 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.98 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.34 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.15 
 
 		 523 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  26.47 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  23.4 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  23.4 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  23.4 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.56 
 
 		 548 aa  80.5  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  24.89 
 
 		 596 aa  80.5  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.27 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  23.98 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.04 
 
 		 518 aa  80.1  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  23.21 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  27 
 
 		 557 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  23.21 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.67 
 
 		 522 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.95 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  23.26 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.08 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  27.79 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  23.29 
 
 		 638 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.6 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.3 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  26.76 
 
 		 557 aa  77  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  25.16 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  22.54 
 
 		 571 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  22.54 
 
 		 571 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  22.54 
 
 		 571 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.3 
 
 		 479 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  23.3 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  22.54 
 
 		 571 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.13 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  22.89 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>