More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42488 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_42488  predicted protein  100 
 
 
467 aa  954    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.206932 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04469  Ribosome biogenesis protein ytm1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4R1]  47.15 
 
 
485 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342767  normal  0.107284 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00480  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  27.38 
 
 
486 aa  164  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29147  predicted protein  27.74 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128359  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43574  predicted protein  27.49 
 
 
499 aa  110  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.74 
 
 
1523 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.08 
 
 
1652 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.79 
 
 
1474 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.16 
 
 
1868 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  27.12 
 
 
1454 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.64 
 
 
1196 aa  90.5  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  28.52 
 
 
696 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.23 
 
 
1262 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.87 
 
 
1221 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.33 
 
 
1831 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.84 
 
 
1557 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.27 
 
 
930 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.39 
 
 
1193 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.59 
 
 
1163 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  26.64 
 
 
1190 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.09 
 
 
1856 aa  84.3  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.75 
 
 
1411 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.32 
 
 
1247 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  27.52 
 
 
1443 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.33 
 
 
676 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  22.52 
 
 
1209 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.73 
 
 
1190 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.68 
 
 
1363 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  26.99 
 
 
1878 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.6 
 
 
1188 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.76 
 
 
1364 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.5 
 
 
1240 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 
1760 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  29.01 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.84 
 
 
919 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.65 
 
 
682 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.56 
 
 
692 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  27.81 
 
 
1661 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.24 
 
 
733 aa  74.3  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.68 
 
 
630 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.06 
 
 
1711 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.9 
 
 
576 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  25.51 
 
 
657 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.09 
 
 
1481 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.18 
 
 
596 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.58 
 
 
947 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  24.78 
 
 
1016 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.82 
 
 
1164 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 
1236 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.11 
 
 
1789 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  25.3 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.74 
 
 
434 aa  70.5  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  24.48 
 
 
1016 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  26.16 
 
 
728 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  26.29 
 
 
1714 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  23.71 
 
 
1214 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.52 
 
 
1552 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.4 
 
 
1357 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.25 
 
 
1553 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  24.9 
 
 
597 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  24.82 
 
 
1416 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  24.19 
 
 
578 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06710  ubiquitin-protein ligase, putative  25.07 
 
 
1012 aa  68.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.994255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  26.56 
 
 
1208 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 
687 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  23.81 
 
 
618 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.824291 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  27.47 
 
 
577 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  23.72 
 
 
928 aa  67.4  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.34 
 
 
737 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  27.61 
 
 
778 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  28.81 
 
 
1477 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  25.69 
 
 
589 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42930  predicted protein  28.57 
 
 
661 aa  66.6  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.816964  normal  0.204876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  24.67 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51367  predicted protein  28.57 
 
 
661 aa  66.6  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.149439  normal  0.0143416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  26.26 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.75 
 
 
1217 aa  66.6  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  21.37 
 
 
565 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.84 
 
 
1267 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.51 
 
 
1211 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  23.1 
 
 
1367 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.15 
 
 
1072 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  25.56 
 
 
840 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  25.1 
 
 
1330 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  22.81 
 
 
516 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.66 
 
 
505 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.43 
 
 
1510 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  22.32 
 
 
473 aa  64.3  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25.68 
 
 
742 aa  63.9  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.57 
 
 
865 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  26.21 
 
 
1280 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  26.22 
 
 
1304 aa  63.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.15 
 
 
677 aa  63.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5471  predicted protein  24.39 
 
 
264 aa  63.5  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.59 
 
 
675 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.54 
 
 
1656 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.6 
 
 
1626 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.76 
 
 
1858 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.08 
 
 
1072 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  24.81 
 
 
520 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>