261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45070 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45070  predicted protein  100 
 
 		 571 aa  1169    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183935  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10742  predicted protein  47.4 
 
 		 153 aa  131  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182467  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34708  predicted protein  42.14 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0219194  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44514  light histidine kinase  33.46 
 
 		 850 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49701  predicted protein  38.24 
 
 		 375 aa  120  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.68 
 
 		 326 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  43.29 
 
 		 325 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 		 1550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39760  predicted protein  42.64 
 
 		 467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0199514  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45099  predicted protein  38.1 
 
 		 230 aa  110  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00726613  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  41.51 
 
 		 251 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.24 
 
 		 326 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 389 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 662 aa  106  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 416 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.03 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.04 
 
 		 321 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 681 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39601  predicted protein  38.1 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19657  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  35.57 
 
 		 542 aa  103  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  36.88 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 		 390 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  39.68 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2664  cyclic diguanylate phosphodiesterase/diguanylate cyclase  38.95 
 
 		 600 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2109  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.11 
 
 		 599 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 512 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.38 
 
 		 318 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 829 aa  101  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.5 
 
 		 740 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.76 
 
 		 743 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 635 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.38 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.84 
 
 		 465 aa  101  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  38.12 
 
 		 316 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34710  predicted protein  37.14 
 
 		 229 aa  99.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0125702  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 		 653 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4543  GAF domain/GGDEF domain/EAL domain protein  37.04 
 
 		 607 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.79 
 
 		 367 aa  98.6  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.62 
 
 		 319 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 680 aa  98.2  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 		 1309 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4177  hypothetical protein  40.62 
 
 		 344 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.878015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  39.42 
 
 		 320 aa  97.8  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  35.32 
 
 		 400 aa  97.8  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  40.61 
 
 		 240 aa  97.4  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  43.07 
 
 		 321 aa  97.4  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  37.5 
 
 		 324 aa  97.4  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  40 
 
 		 276 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 267 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  39.38 
 
 		 327 aa  97.1  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.66 
 
 		 722 aa  96.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  39.63 
 
 		 743 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 1002 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  34.68 
 
 		 500 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 929 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.12 
 
 		 327 aa  95.9  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.7 
 
 		 624 aa  95.9  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  38.04 
 
 		 343 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 323 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.05 
 
 		 506 aa  95.5  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.74 
 
 		 348 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.74 
 
 		 348 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49117  predicted protein  38.4 
 
 		 508 aa  94.7  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.300412  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.88 
 
 		 323 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  36.41 
 
 		 694 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44688  predicted protein  33.8 
 
 		 539 aa  94.7  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  36.88 
 
 		 323 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4221  EAL:GAF  35.8 
 
 		 607 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  38.57 
 
 		 417 aa  94.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  36.88 
 
 		 323 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.99 
 
 		 603 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 		 1224 aa  94  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 		 1125 aa  94  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5220  putative GAF sensor protein  35.71 
 
 		 182 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.583285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2011  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.56 
 
 		 321 aa  93.6  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0323841  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 500 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.43 
 
 		 1423 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 356 aa  92.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  41.48 
 
 		 438 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.69 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0329  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.94 
 
 		 336 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.832493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 897 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1974  diguanylate cyclase  43.94 
 
 		 336 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.5 
 
 		 323 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  41.04 
 
 		 781 aa  91.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  40.65 
 
 		 595 aa  91.3  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.11 
 
 		 323 aa  91.3  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  39.18 
 
 		 1125 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.67 
 
 		 728 aa  90.5  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 1191 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0522  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.51 
 
 		 1114 aa  90.1  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1877  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.66 
 
 		 722 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 1965 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 514 aa  89.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  37.06 
 
 		 1041 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  38.81 
 
 		 497 aa  90.1  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2059  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.2 
 
 		 718 aa  89.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0475762  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 837 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  31.84 
 
 		 406 aa  89.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0192  serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 		 471 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>