111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2371 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  761    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  53.83 
 
 
378 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  66.07 
 
 
224 aa  313  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  42.26 
 
 
371 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  41.82 
 
 
363 aa  275  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  38.61 
 
 
368 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  36.84 
 
 
374 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  58.86 
 
 
227 aa  216  5.9999999999999996e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  34.52 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  31.41 
 
 
377 aa  202  9e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  33.78 
 
 
378 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  27.13 
 
 
374 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  46.28 
 
 
459 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  56.84 
 
 
96 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  27.34 
 
 
378 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  29.76 
 
 
451 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  38.69 
 
 
435 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  38.66 
 
 
478 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  38.66 
 
 
459 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  31.36 
 
 
465 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  35.94 
 
 
466 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  35.54 
 
 
429 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  27.62 
 
 
465 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  30.12 
 
 
527 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  33.88 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  34.38 
 
 
464 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  32.26 
 
 
457 aa  77  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  31.47 
 
 
514 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  32.12 
 
 
508 aa  70.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  33.63 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  33.33 
 
 
467 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  32.62 
 
 
555 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  23.89 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  23.96 
 
 
390 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  27.81 
 
 
510 aa  63.2  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  23.24 
 
 
390 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  24.23 
 
 
390 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  23.96 
 
 
390 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  23.31 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  28.12 
 
 
483 aa  60.8  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  22.97 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  29.5 
 
 
461 aa  60.1  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  23.04 
 
 
390 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  34.41 
 
 
513 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  27.59 
 
 
595 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  21.49 
 
 
386 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  23.26 
 
 
395 aa  56.2  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  29.1 
 
 
565 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  36.25 
 
 
388 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  24.4 
 
 
349 aa  53.1  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  26.67 
 
 
617 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  29.77 
 
 
457 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  48.98 
 
 
131 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  25.54 
 
 
397 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  25.14 
 
 
393 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  35.53 
 
 
441 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  26.6 
 
 
460 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  26.6 
 
 
460 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  35.44 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  24.41 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  35.21 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1514  ATPase-like protein  47.92 
 
 
131 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  29.09 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  33.33 
 
 
556 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  25.93 
 
 
376 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  31 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  32.14 
 
 
451 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  26.79 
 
 
533 aa  47  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  37.84 
 
 
419 aa  46.6  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  21.81 
 
 
392 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  21.81 
 
 
392 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  21.81 
 
 
392 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  21.81 
 
 
436 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  21.81 
 
 
436 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  21.81 
 
 
436 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  21.81 
 
 
436 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  33.7 
 
 
385 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  28.95 
 
 
529 aa  46.2  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  21.5 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  25.93 
 
 
442 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1487  hypothetical protein  22.25 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  42.5 
 
 
653 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  27.39 
 
 
680 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  51.16 
 
 
685 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  34.57 
 
 
486 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  36.62 
 
 
388 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  44.19 
 
 
583 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  22.06 
 
 
571 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  46.51 
 
 
580 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1988  hypothetical protein  38.89 
 
 
347 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  23.35 
 
 
572 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  33.33 
 
 
399 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  31.34 
 
 
565 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  29.11 
 
 
394 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  31.65 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.78 
 
 
677 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.78 
 
 
677 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  35.21 
 
 
386 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  35 
 
 
388 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  34.92 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>