More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2893 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  100 
 
 		 604 aa  1201    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  28.83 
 
 		 597 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  23.9 
 
 		 590 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0350  Na+/solute symporter  25.98 
 
 		 489 aa  163  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  24.71 
 
 		 590 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  30.43 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  28.27 
 
 		 517 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  27.7 
 
 		 570 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  25.63 
 
 		 556 aa  142  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  27.56 
 
 		 575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.22 
 
 		 533 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.84 
 
 		 592 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  25.37 
 
 		 586 aa  107  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  25.05 
 
 		 585 aa  106  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  25.88 
 
 		 587 aa  104  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  25.77 
 
 		 588 aa  103  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  25.64 
 
 		 505 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.45 
 
 		 522 aa  101  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  25.87 
 
 		 505 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  25.17 
 
 		 520 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.72 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  24.15 
 
 		 509 aa  99  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  24.39 
 
 		 520 aa  98.6  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.26 
 
 		 526 aa  97.8  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.65 
 
 		 523 aa  97.1  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.54 
 
 		 519 aa  97.4  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  22.85 
 
 		 520 aa  97.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25.17 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.62 
 
 		 483 aa  93.6  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.94 
 
 		 522 aa  93.2  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  22.83 
 
 		 472 aa  93.6  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  23.97 
 
 		 588 aa  91.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  24.72 
 
 		 509 aa  91.3  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.84 
 
 		 520 aa  90.5  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  23.88 
 
 		 596 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.97 
 
 		 561 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  26.69 
 
 		 598 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  24.43 
 
 		 603 aa  88.6  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.5 
 
 		 487 aa  87.4  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  25.46 
 
 		 577 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.17 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  25.45 
 
 		 551 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  23.52 
 
 		 561 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  24.6 
 
 		 529 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  24.68 
 
 		 557 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.08 
 
 		 522 aa  84.3  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  24.73 
 
 		 557 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  23.72 
 
 		 587 aa  83.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.33 
 
 		 548 aa  83.2  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  21.88 
 
 		 498 aa  83.2  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  24.34 
 
 		 587 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  21.96 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  22.54 
 
 		 565 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  24.32 
 
 		 599 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  25.12 
 
 		 587 aa  80.5  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  24.11 
 
 		 583 aa  80.5  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  22.2 
 
 		 575 aa  80.5  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  23.2 
 
 		 484 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  23.21 
 
 		 527 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  23 
 
 		 545 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  23.05 
 
 		 570 aa  79.3  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  22.88 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.73 
 
 		 565 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  25.46 
 
 		 583 aa  78.2  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  22.93 
 
 		 568 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  22.81 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  23.35 
 
 		 538 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  26.29 
 
 		 584 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  24.69 
 
 		 560 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  23.63 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  23.83 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.89 
 
 		 613 aa  75.5  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  22.93 
 
 		 527 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.41 
 
 		 526 aa  74.3  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  23.58 
 
 		 492 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  25 
 
 		 528 aa  73.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.63 
 
 		 574 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  22.43 
 
 		 562 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  22.52 
 
 		 569 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  21.89 
 
 		 549 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  22.6 
 
 		 562 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  23.46 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  23.65 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  22.31 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  23.09 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  22.14 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  23.65 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  23.65 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  27.4 
 
 		 587 aa  70.9  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  23.98 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  23.46 
 
 		 492 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  23.36 
 
 		 492 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  22.64 
 
 		 488 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  23.41 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  24.08 
 
 		 487 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  23.25 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  23.86 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  21.24 
 
 		 532 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  22.36 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  22.62 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>