More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0202 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  100 
 
 		 203 aa  416  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  53.96 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  53.96 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  52.48 
 
 		 200 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  52.48 
 
 		 200 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 200 aa  207  8e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  52.48 
 
 		 200 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 200 aa  205  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 200 aa  204  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 200 aa  204  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 200 aa  204  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 200 aa  204  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 200 aa  204  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 200 aa  204  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 200 aa  204  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 200 aa  204  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  53.2 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  48.77 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  50.25 
 
 		 201 aa  198  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 200 aa  198  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 202 aa  197  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  51.49 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  50.97 
 
 		 206 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  50.49 
 
 		 201 aa  194  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 208 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 201 aa  194  9e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 206 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.5 
 
 		 200 aa  194  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  50.98 
 
 		 203 aa  194  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  51.64 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 208 aa  192  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  51.46 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 208 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  52.13 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 203 aa  192  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 203 aa  191  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  50.98 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  48.78 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  48.51 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  48.51 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  48.51 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 205 aa  188  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  49.03 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  49.03 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 208 aa  187  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  47.32 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  48.8 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  48.04 
 
 		 203 aa  185  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 202 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  47.32 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  49.28 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  48.53 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  47.42 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.11 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  46.41 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  45.93 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  49.28 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  44.5 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  44.5 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 203 aa  178  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  43.35 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1487  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 202 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 203 aa  178  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  45.93 
 
 		 208 aa  177  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 208 aa  177  7e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  49.76 
 
 		 262 aa  177  8e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 208 aa  175  3e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 203 aa  175  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  45.93 
 
 		 209 aa  175  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  44.88 
 
 		 203 aa  175  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  46.41 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  46.41 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  46.41 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2554  30S ribosomal protein S4  48.51 
 
 		 202 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  46.41 
 
 		 208 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>