244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0905 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0905  Spermine synthase  100 
 
 		 805 aa  1627    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0140843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2430  spermine synthase  24.84 
 
 		 704 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  24.48 
 
 		 757 aa  158  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  25.8 
 
 		 515 aa  85.5  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  36.59 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  25.64 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  33.33 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  25.96 
 
 		 520 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  25.96 
 
 		 520 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  23.23 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  25.17 
 
 		 538 aa  79.7  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  23.23 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  26.7 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  26.24 
 
 		 536 aa  78.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  23.3 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  28.86 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  29.11 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  27.96 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  25 
 
 		 503 aa  77  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  31.69 
 
 		 522 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  28.41 
 
 		 285 aa  76.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  22.22 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  22.22 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  32.04 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  25.82 
 
 		 504 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  25.82 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  25.82 
 
 		 504 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  25.82 
 
 		 504 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  33.61 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  28.25 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  28.02 
 
 		 521 aa  75.1  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  26.45 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  28.25 
 
 		 521 aa  74.7  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  26.45 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  32.79 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  32.79 
 
 		 276 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  26.73 
 
 		 304 aa  73.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  24.48 
 
 		 503 aa  73.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  24.37 
 
 		 498 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  31.72 
 
 		 285 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  31.72 
 
 		 285 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0604  spermidine synthase  31.03 
 
 		 285 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  27.51 
 
 		 527 aa  72.8  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  25.16 
 
 		 533 aa  73.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  26.86 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  31.03 
 
 		 285 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  27.75 
 
 		 312 aa  73.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0637  spermidine synthase  31.03 
 
 		 285 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  32.39 
 
 		 295 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  26.49 
 
 		 519 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  25.84 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  30.82 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  24.92 
 
 		 782 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  28.16 
 
 		 277 aa  72  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  25.78 
 
 		 521 aa  72  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  30.52 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  29.5 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  26.25 
 
 		 523 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  28.84 
 
 		 285 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  28.84 
 
 		 285 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  25.11 
 
 		 982 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  26.8 
 
 		 283 aa  70.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  28.84 
 
 		 285 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  28.84 
 
 		 285 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  28.84 
 
 		 285 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  28.84 
 
 		 285 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  28.57 
 
 		 275 aa  69.7  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  34.88 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  32.28 
 
 		 283 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  32.28 
 
 		 283 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  28.84 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  27.03 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  29.17 
 
 		 285 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  29.45 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  23.47 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  25.28 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  27.1 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  33.88 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  28.71 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  25.5 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  32.21 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  28.57 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.404656 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  25.88 
 
 		 292 aa  67.4  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  27.13 
 
 		 287 aa  67.4  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  25.98 
 
 		 844 aa  67.4  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  28.57 
 
 		 316 aa  67  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  32.23 
 
 		 279 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  22.16 
 
 		 551 aa  66.6  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  24.87 
 
 		 529 aa  66.6  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  29.6 
 
 		 300 aa  66.2  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  24.73 
 
 		 283 aa  66.6  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  25.81 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  24.8 
 
 		 983 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  33.33 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  25.81 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  28.48 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  21.99 
 
 		 1017 aa  65.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  31.33 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  31.01 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  33.06 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>