240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1707 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 396 aa  790    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  79.13 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  69.33 
 
 		 393 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  69.49 
 
 		 397 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  70.36 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  67.87 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  69.41 
 
 		 396 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  56.63 
 
 		 397 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  54.12 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  54.64 
 
 		 386 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  53.87 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  54.9 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  55.04 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  53.12 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  45.91 
 
 		 384 aa  309  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  46.67 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  46.17 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  43.08 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  44.94 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  42.9 
 
 		 395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  42.9 
 
 		 395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  44.97 
 
 		 379 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  44.71 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  41.46 
 
 		 394 aa  272  9e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  41.09 
 
 		 391 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  42.97 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  44.76 
 
 		 386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  42.97 
 
 		 389 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  44.21 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  41.65 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  41.28 
 
 		 388 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  41.09 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  39.28 
 
 		 407 aa  235  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  40 
 
 		 379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  39.3 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  40.62 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  37.11 
 
 		 386 aa  216  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  38.64 
 
 		 399 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  37.09 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  34.39 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  34.9 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  31.67 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  34.82 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  35.61 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  36.22 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  35.81 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  36.51 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1394  lipid-A-disaccharide synthase  38.86 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295043  normal  0.0154859 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  39.53 
 
 		 401 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  34.18 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  36.8 
 
 		 410 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  40.58 
 
 		 390 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  35.08 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  36.55 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  36.6 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  38.12 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  32.99 
 
 		 384 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  33.93 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  34.27 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  36.55 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  38.32 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  34.38 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  33.97 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  32.65 
 
 		 389 aa  186  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  35.14 
 
 		 376 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  35.14 
 
 		 389 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  32.76 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  35.14 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  32.82 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  33.68 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  35.65 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  32.31 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  34.63 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  34.63 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  35.65 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  35.33 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  32.12 
 
 		 393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  32 
 
 		 402 aa  183  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  37.72 
 
 		 377 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  34.63 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  35.65 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  34.94 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  35.6 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  34.77 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  31.36 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  34.29 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  35.82 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  36.09 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  32.23 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  34.29 
 
 		 383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  31.2 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  31.94 
 
 		 379 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 380 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  33.63 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  37.15 
 
 		 378 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  33.08 
 
 		 392 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  37.3 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>