More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1189 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 480 aa  921    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.72 
 
 		 485 aa  351  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.58 
 
 		 473 aa  349  7e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  50.34 
 
 		 473 aa  342  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.61 
 
 		 470 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  47.1 
 
 		 485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.1 
 
 		 485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.1 
 
 		 485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  48.8 
 
 		 481 aa  327  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.52 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  47.31 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.68 
 
 		 471 aa  318  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  47.43 
 
 		 490 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.63 
 
 		 494 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.82 
 
 		 495 aa  286  7e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.16 
 
 		 465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  43.58 
 
 		 533 aa  276  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  42.58 
 
 		 476 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.92 
 
 		 511 aa  259  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.51 
 
 		 499 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.6 
 
 		 497 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.2 
 
 		 459 aa  250  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.1 
 
 		 536 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.15 
 
 		 487 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.76 
 
 		 501 aa  226  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.45 
 
 		 504 aa  225  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.45 
 
 		 495 aa  219  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40.67 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.12 
 
 		 526 aa  203  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  43.55 
 
 		 534 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.97 
 
 		 519 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.62 
 
 		 490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.17 
 
 		 556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  32.06 
 
 		 517 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.2 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.62 
 
 		 528 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.52 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  41.12 
 
 		 525 aa  178  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  38.49 
 
 		 558 aa  177  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.65 
 
 		 524 aa  176  8e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.61 
 
 		 529 aa  176  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.34 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.06 
 
 		 492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  33.82 
 
 		 496 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 		 499 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  39.38 
 
 		 532 aa  173  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.39 
 
 		 499 aa  172  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  35.96 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.32 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.87 
 
 		 518 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.53 
 
 		 499 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.52 
 
 		 490 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.61 
 
 		 530 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  34.56 
 
 		 501 aa  170  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  34.56 
 
 		 501 aa  170  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.26 
 
 		 523 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  37.47 
 
 		 482 aa  169  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  31.25 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.9 
 
 		 556 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  35.41 
 
 		 514 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  32.51 
 
 		 508 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 494 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  35.19 
 
 		 499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.44 
 
 		 524 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.51 
 
 		 524 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.27 
 
 		 514 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 494 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.47 
 
 		 494 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.93 
 
 		 492 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.83 
 
 		 515 aa  166  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.01 
 
 		 501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.91 
 
 		 504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.79 
 
 		 531 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  30.61 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  32.11 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  30.14 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.12 
 
 		 494 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.46 
 
 		 533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.85 
 
 		 531 aa  163  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  31.64 
 
 		 524 aa  163  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  34.56 
 
 		 493 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1232  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.16 
 
 		 496 aa  162  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271029  normal  0.25171 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  31.26 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  38.96 
 
 		 507 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.36 
 
 		 515 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  36.69 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  33.47 
 
 		 499 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  33.96 
 
 		 496 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  31.27 
 
 		 498 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.33 
 
 		 521 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.7 
 
 		 480 aa  160  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  32.64 
 
 		 530 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.54 
 
 		 501 aa  160  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.16 
 
 		 516 aa  160  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.27 
 
 		 546 aa  160  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.18 
 
 		 479 aa  160  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.32 
 
 		 508 aa  159  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  29.67 
 
 		 512 aa  159  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.98 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.26 
 
 		 511 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>