More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1922 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  88.78 
 
 		 490 aa  754    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 490 aa  962    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  63.14 
 
 		 490 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  64.39 
 
 		 493 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  48.37 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  48.37 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  49.9 
 
 		 499 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.86 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.86 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  47.74 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.46 
 
 		 500 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  48.35 
 
 		 499 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  49.29 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.67 
 
 		 508 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  48.6 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.9 
 
 		 496 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.9 
 
 		 496 aa  363  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.95 
 
 		 522 aa  361  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  49.08 
 
 		 519 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.41 
 
 		 510 aa  355  6.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.43 
 
 		 500 aa  352  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.88 
 
 		 499 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.92 
 
 		 538 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.51 
 
 		 507 aa  335  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.69 
 
 		 507 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.29 
 
 		 507 aa  323  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.2 
 
 		 539 aa  312  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  37.77 
 
 		 463 aa  294  3e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  45.37 
 
 		 523 aa  292  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.95 
 
 		 485 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  36.96 
 
 		 466 aa  286  5.999999999999999e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.15 
 
 		 468 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  39.93 
 
 		 581 aa  277  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  41.7 
 
 		 528 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.14 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4460  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.39 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.66 
 
 		 492 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.19 
 
 		 530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 		 515 aa  232  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1547  hypothetical protein  44.44 
 
 		 526 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.45 
 
 		 457 aa  227  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  36.13 
 
 		 524 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.86 
 
 		 521 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  38.4 
 
 		 514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.4 
 
 		 513 aa  221  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.22 
 
 		 524 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.79 
 
 		 510 aa  217  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.31 
 
 		 533 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.88 
 
 		 490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.84 
 
 		 499 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.08 
 
 		 492 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.92 
 
 		 519 aa  210  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.71 
 
 		 528 aa  209  8e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  33.4 
 
 		 515 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.81 
 
 		 500 aa  206  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.49 
 
 		 530 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 521 aa  206  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.69 
 
 		 524 aa  206  9e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.74 
 
 		 498 aa  205  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.01 
 
 		 524 aa  205  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.34 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.18 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.49 
 
 		 518 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  33.13 
 
 		 508 aa  203  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  32.76 
 
 		 513 aa  203  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  36.61 
 
 		 502 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.89 
 
 		 500 aa  202  9e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  35.91 
 
 		 522 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.64 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.82 
 
 		 519 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.19 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  36.36 
 
 		 535 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.42 
 
 		 532 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.49 
 
 		 523 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  36.18 
 
 		 502 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.06 
 
 		 531 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  33.4 
 
 		 498 aa  199  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.8 
 
 		 524 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  34.56 
 
 		 512 aa  199  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.44 
 
 		 531 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1191  YjeF-related protein-like protein  38.85 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  31.66 
 
 		 517 aa  196  9e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  37.12 
 
 		 531 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.53 
 
 		 520 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.93 
 
 		 525 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.19 
 
 		 502 aa  195  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  36.16 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  35.83 
 
 		 496 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.1 
 
 		 524 aa  194  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  33.81 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  34.17 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.64 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.47 
 
 		 499 aa  192  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  33.89 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.66 
 
 		 533 aa  190  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  35.32 
 
 		 436 aa  189  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.46 
 
 		 533 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  39.15 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.7 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  36.02 
 
 		 500 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>