More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3307 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
519 aa  1039    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.55 
 
 
525 aa  363  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.13 
 
 
533 aa  362  6e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.49 
 
 
515 aa  354  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  43.81 
 
 
514 aa  352  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41 
 
 
521 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  41.33 
 
 
519 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.97 
 
 
510 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.28 
 
 
514 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.41 
 
 
520 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  40.15 
 
 
517 aa  348  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  43.19 
 
 
530 aa  340  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.56 
 
 
513 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.96 
 
 
517 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.76 
 
 
521 aa  336  7e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.98 
 
 
530 aa  334  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.23 
 
 
524 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.07 
 
 
532 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.79 
 
 
524 aa  326  6e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.2 
 
 
509 aa  326  7e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.92 
 
 
524 aa  325  9e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.96 
 
 
521 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  38.86 
 
 
498 aa  316  8e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  42.83 
 
 
522 aa  312  9e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  37.2 
 
 
524 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.37 
 
 
500 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.17 
 
 
498 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.27 
 
 
501 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.88 
 
 
533 aa  299  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.12 
 
 
528 aa  293  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.59 
 
 
524 aa  292  8e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.52 
 
 
533 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.76 
 
 
490 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  30.63 
 
 
499 aa  289  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.94 
 
 
519 aa  286  9e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.29 
 
 
506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  30.63 
 
 
499 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.06 
 
 
511 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.28 
 
 
492 aa  276  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.28 
 
 
504 aa  276  7e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.73 
 
 
516 aa  276  9e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  39.65 
 
 
500 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.98 
 
 
514 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  37.91 
 
 
488 aa  271  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  38.1 
 
 
486 aa  269  8e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  34.16 
 
 
511 aa  269  8.999999999999999e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  39.35 
 
 
512 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  39.31 
 
 
535 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.05 
 
 
502 aa  266  8.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
515 aa  262  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  39.07 
 
 
506 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  35.74 
 
 
504 aa  256  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  35.55 
 
 
504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.94 
 
 
493 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  35.55 
 
 
504 aa  254  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.74 
 
 
500 aa  253  5.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  36.67 
 
 
512 aa  253  7e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6197  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.62 
 
 
514 aa  253  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.327318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  36.4 
 
 
514 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.65 
 
 
499 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  34.71 
 
 
499 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  38.48 
 
 
502 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  37.21 
 
 
526 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  33.01 
 
 
490 aa  250  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  41.09 
 
 
436 aa  250  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  36.79 
 
 
510 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.77 
 
 
518 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.59 
 
 
520 aa  249  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.04 
 
 
511 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.17 
 
 
499 aa  246  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  38.34 
 
 
502 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.73 
 
 
494 aa  246  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.98 
 
 
513 aa  246  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.96 
 
 
529 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.51 
 
 
512 aa  246  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.09 
 
 
518 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  37.04 
 
 
462 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40 
 
 
492 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  35.83 
 
 
514 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  34.57 
 
 
492 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  34.9 
 
 
493 aa  243  6e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  35.83 
 
 
514 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  35.83 
 
 
514 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  35.83 
 
 
514 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  35.83 
 
 
514 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  34.82 
 
 
510 aa  243  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  34.68 
 
 
512 aa  243  9e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2365  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.8 
 
 
509 aa  243  9e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.316959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  36.33 
 
 
499 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  34.71 
 
 
493 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.45 
 
 
499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.84 
 
 
499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  34.63 
 
 
510 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.94 
 
 
508 aa  239  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.51 
 
 
511 aa  239  9e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.06 
 
 
494 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.63 
 
 
515 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  34.63 
 
 
515 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  34.63 
 
 
510 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.86 
 
 
509 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>