More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1517 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  100 
 
 
581 aa  1151    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  50.59 
 
 
523 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  45.06 
 
 
528 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4460  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.6 
 
 
509 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  41.37 
 
 
499 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  41.35 
 
 
499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.42 
 
 
501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  40.9 
 
 
499 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.31 
 
 
508 aa  291  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.04 
 
 
510 aa  287  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.51 
 
 
496 aa  286  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  41.59 
 
 
499 aa  286  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.66 
 
 
522 aa  281  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  40.24 
 
 
499 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  37.21 
 
 
501 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  37.21 
 
 
501 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.59 
 
 
500 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.1 
 
 
501 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.86 
 
 
485 aa  269  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.12 
 
 
490 aa  267  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  39.9 
 
 
519 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.36 
 
 
507 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.59 
 
 
538 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  37.08 
 
 
493 aa  260  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.19 
 
 
507 aa  259  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.01 
 
 
507 aa  256  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.5 
 
 
539 aa  254  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.66 
 
 
499 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.31 
 
 
490 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.66 
 
 
490 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  31.29 
 
 
463 aa  243  7.999999999999999e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  31.54 
 
 
466 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.29 
 
 
500 aa  239  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.99 
 
 
496 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.21 
 
 
476 aa  208  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.93 
 
 
499 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  32.01 
 
 
498 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.9 
 
 
457 aa  189  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.58 
 
 
468 aa  185  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.98 
 
 
521 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.05 
 
 
524 aa  181  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1547  hypothetical protein  39.6 
 
 
526 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  31.51 
 
 
496 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.3 
 
 
493 aa  170  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  30.16 
 
 
514 aa  170  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.39 
 
 
490 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  33.33 
 
 
502 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  34.69 
 
 
502 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.76 
 
 
525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  31.01 
 
 
496 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.83 
 
 
514 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.52 
 
 
509 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.03 
 
 
511 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  31.34 
 
 
499 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.41 
 
 
524 aa  160  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  28.13 
 
 
508 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  30.3 
 
 
488 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  32.39 
 
 
519 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30 
 
 
521 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.74 
 
 
520 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1191  YjeF-related protein-like protein  34.99 
 
 
449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  30.48 
 
 
486 aa  157  6e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  33.33 
 
 
530 aa  156  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.92 
 
 
517 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  30.67 
 
 
500 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.02 
 
 
533 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.53 
 
 
501 aa  154  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  29.83 
 
 
514 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1786  YjeF-related protein-like  30.89 
 
 
468 aa  153  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  30.46 
 
 
515 aa  153  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.76 
 
 
504 aa  153  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.23 
 
 
528 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33 
 
 
530 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.05 
 
 
519 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  29.31 
 
 
522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  28.18 
 
 
517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  29.2 
 
 
514 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  29.2 
 
 
514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  29.2 
 
 
514 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  29.2 
 
 
514 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  29.85 
 
 
506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  29.2 
 
 
514 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.19 
 
 
512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  28.69 
 
 
510 aa  148  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.06 
 
 
515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  29.78 
 
 
513 aa  147  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  27.13 
 
 
504 aa  147  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  33.02 
 
 
436 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  29.25 
 
 
510 aa  146  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  29.03 
 
 
515 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.84 
 
 
515 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  28.84 
 
 
510 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  27.99 
 
 
490 aa  145  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  29.03 
 
 
515 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  27.48 
 
 
508 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  28.5 
 
 
515 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.56 
 
 
513 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  26.96 
 
 
504 aa  145  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  26.79 
 
 
504 aa  144  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.96 
 
 
533 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>