More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1527 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  81.44 
 
 
531 aa  815    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
531 aa  1024    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  94.92 
 
 
531 aa  955    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  54.26 
 
 
526 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  53.63 
 
 
535 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.31 
 
 
529 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  45.56 
 
 
533 aa  339  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.26 
 
 
530 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  50 
 
 
531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  50 
 
 
531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  50 
 
 
531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  50 
 
 
531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  50 
 
 
531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  49.8 
 
 
531 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  50.19 
 
 
514 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.19 
 
 
514 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  50 
 
 
531 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2133  carbohydrate kinase, putative  50 
 
 
531 aa  319  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1358  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.42 
 
 
514 aa  316  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624281  normal  0.973105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  49.81 
 
 
514 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  45.82 
 
 
506 aa  309  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.49 
 
 
514 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.29 
 
 
514 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.71 
 
 
514 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  45.09 
 
 
522 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.3 
 
 
513 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  45.45 
 
 
487 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.65 
 
 
504 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2596  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.8 
 
 
486 aa  259  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.26 
 
 
517 aa  257  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.81 
 
 
502 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  46.62 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1426  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.43 
 
 
514 aa  255  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  40 
 
 
494 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1982  hypothetical protein  43.65 
 
 
510 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0776556 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  36.35 
 
 
498 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  41.3 
 
 
503 aa  251  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.56 
 
 
499 aa  249  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  39.44 
 
 
508 aa  249  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.34 
 
 
492 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.19 
 
 
499 aa  246  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2854  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.35 
 
 
548 aa  244  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.212974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  38.54 
 
 
510 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.42 
 
 
490 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.17 
 
 
515 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  38.17 
 
 
510 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1984  hypothetical protein  45.11 
 
 
487 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  38.17 
 
 
510 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2698  hypothetical protein  42.83 
 
 
523 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  38.17 
 
 
515 aa  240  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  38.17 
 
 
515 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  39.12 
 
 
504 aa  240  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  38.17 
 
 
515 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  37.97 
 
 
515 aa  239  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  38.17 
 
 
515 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  35.38 
 
 
488 aa  239  9e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  38.92 
 
 
504 aa  239  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  38.76 
 
 
514 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  35.21 
 
 
490 aa  239  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  38.76 
 
 
514 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  38.76 
 
 
514 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  38.76 
 
 
514 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  38.92 
 
 
504 aa  238  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  38.76 
 
 
514 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  35.38 
 
 
486 aa  236  8e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  39.33 
 
 
514 aa  234  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  39.22 
 
 
436 aa  233  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.75 
 
 
519 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  36.64 
 
 
512 aa  231  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  40.08 
 
 
510 aa  230  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.78 
 
 
492 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.35 
 
 
494 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  40.29 
 
 
462 aa  226  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  38.86 
 
 
499 aa  226  7e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.31 
 
 
499 aa  226  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.74 
 
 
494 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.12 
 
 
499 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.36 
 
 
499 aa  224  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  40.21 
 
 
513 aa  224  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.73 
 
 
499 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  34.61 
 
 
524 aa  223  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.28 
 
 
494 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  38.07 
 
 
500 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  37.3 
 
 
499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  37.5 
 
 
496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.73 
 
 
488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  41.54 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.7 
 
 
509 aa  220  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  38.88 
 
 
502 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  37.25 
 
 
493 aa  219  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.77 
 
 
494 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  37.16 
 
 
493 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  39.07 
 
 
502 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.44 
 
 
533 aa  217  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.25 
 
 
501 aa  216  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.74 
 
 
501 aa  216  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  36.47 
 
 
522 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  38.51 
 
 
499 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.31 
 
 
494 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  39.41 
 
 
519 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>