More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3771 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
519 aa  1031    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.71 
 
 
517 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.14 
 
 
532 aa  497  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.14 
 
 
530 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  50.97 
 
 
530 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  47.35 
 
 
517 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.49 
 
 
515 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.35 
 
 
521 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.38 
 
 
525 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.6 
 
 
510 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.65 
 
 
524 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  43.82 
 
 
514 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.66 
 
 
521 aa  361  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.58 
 
 
516 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.25 
 
 
533 aa  360  5e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  43.79 
 
 
519 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.21 
 
 
520 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.75 
 
 
514 aa  347  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.25 
 
 
521 aa  345  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.18 
 
 
524 aa  332  1e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.06 
 
 
533 aa  327  4.0000000000000003e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.54 
 
 
511 aa  323  6e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  38.52 
 
 
524 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.65 
 
 
498 aa  317  3e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.8 
 
 
528 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.52 
 
 
513 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.26 
 
 
500 aa  312  9e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  40.7 
 
 
522 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.29 
 
 
509 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.42 
 
 
524 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  36.07 
 
 
499 aa  306  7e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  36.07 
 
 
499 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.94 
 
 
533 aa  293  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.02 
 
 
492 aa  292  9e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.76 
 
 
524 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  36.88 
 
 
512 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.72 
 
 
506 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.26 
 
 
507 aa  270  4e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  38.51 
 
 
507 aa  269  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  35.4 
 
 
498 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.65 
 
 
504 aa  264  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.91 
 
 
501 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.55 
 
 
513 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.57 
 
 
504 aa  259  7e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.47 
 
 
493 aa  257  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.89 
 
 
511 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.25 
 
 
502 aa  257  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.9 
 
 
501 aa  257  4e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.11 
 
 
516 aa  256  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.29 
 
 
514 aa  254  3e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  37.45 
 
 
514 aa  253  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  34.55 
 
 
513 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.5 
 
 
518 aa  252  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.28 
 
 
515 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  36.52 
 
 
494 aa  250  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.94 
 
 
519 aa  247  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  38.64 
 
 
510 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.21 
 
 
490 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  34.17 
 
 
499 aa  244  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  36.31 
 
 
510 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.53 
 
 
515 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.96 
 
 
542 aa  241  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.5 
 
 
504 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  36.97 
 
 
510 aa  242  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  37.1 
 
 
515 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  37.31 
 
 
510 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  37.31 
 
 
515 aa  239  8e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  37.31 
 
 
515 aa  239  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  37.31 
 
 
515 aa  239  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  37.02 
 
 
515 aa  239  9e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  37.23 
 
 
462 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1502  hypothetical protein  41.76 
 
 
509 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16359  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.93 
 
 
490 aa  237  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  36.38 
 
 
512 aa  236  6e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  36.42 
 
 
488 aa  236  6e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  36.61 
 
 
486 aa  235  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.9 
 
 
502 aa  234  3e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  36.31 
 
 
500 aa  233  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.78 
 
 
509 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  33.02 
 
 
524 aa  233  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.44 
 
 
523 aa  233  8.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  35.73 
 
 
514 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2365  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.59 
 
 
509 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.316959  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  35.73 
 
 
514 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.38 
 
 
528 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  35.53 
 
 
514 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.57 
 
 
527 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  35.73 
 
 
514 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.41 
 
 
487 aa  231  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.11 
 
 
494 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  35.62 
 
 
504 aa  230  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  30.4 
 
 
511 aa  230  4e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.74 
 
 
499 aa  230  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  35.73 
 
 
514 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.08 
 
 
492 aa  229  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  35.41 
 
 
504 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  35.41 
 
 
504 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.39 
 
 
494 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1090  YjeF-related protein-like  35.06 
 
 
526 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.393825  normal  0.597478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.45 
 
 
499 aa  228  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>