More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2528 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
524 aa  1054    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  62.33 
 
 
525 aa  631  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  60.04 
 
 
514 aa  586  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54 
 
 
521 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  54.84 
 
 
519 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.05 
 
 
520 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.17 
 
 
514 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.79 
 
 
515 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.85 
 
 
533 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47 
 
 
530 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.78 
 
 
521 aa  392  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.65 
 
 
519 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  40.9 
 
 
517 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  44.19 
 
 
530 aa  363  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.51 
 
 
516 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.2 
 
 
517 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.21 
 
 
532 aa  346  6e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.31 
 
 
510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.98 
 
 
524 aa  339  8e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.16 
 
 
524 aa  330  3e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  38.61 
 
 
524 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.04 
 
 
524 aa  318  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  39 
 
 
522 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  35.84 
 
 
499 aa  313  6.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.59 
 
 
513 aa  312  7.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.89 
 
 
521 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.64 
 
 
509 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.7 
 
 
528 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.36 
 
 
511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.4 
 
 
492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37 
 
 
533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.72 
 
 
519 aa  302  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.94 
 
 
500 aa  300  4e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.86 
 
 
498 aa  299  8e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  35.07 
 
 
499 aa  299  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  37.43 
 
 
498 aa  293  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.64 
 
 
506 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.85 
 
 
511 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.7 
 
 
493 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.25 
 
 
533 aa  276  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.79 
 
 
504 aa  276  7e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.62 
 
 
479 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.67 
 
 
556 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  35.62 
 
 
499 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  35.95 
 
 
512 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.63 
 
 
501 aa  263  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  36.33 
 
 
512 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.26 
 
 
490 aa  259  9e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.93 
 
 
567 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0069  hypothetical protein  34.29 
 
 
504 aa  257  4e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  35.99 
 
 
503 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.65 
 
 
492 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.12 
 
 
556 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1502  hypothetical protein  41.68 
 
 
509 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16359  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  38.74 
 
 
436 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.1 
 
 
513 aa  252  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  34.91 
 
 
512 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.62 
 
 
514 aa  251  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.1 
 
 
501 aa  250  5e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  35.83 
 
 
486 aa  249  6e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.87 
 
 
518 aa  249  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  35.43 
 
 
488 aa  247  3e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.66 
 
 
512 aa  248  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.35 
 
 
516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  39.17 
 
 
496 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.12 
 
 
502 aa  244  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  34.98 
 
 
514 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  36.29 
 
 
500 aa  242  9e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  33.84 
 
 
511 aa  241  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  33.65 
 
 
513 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  35.43 
 
 
502 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.62 
 
 
499 aa  240  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  34.77 
 
 
510 aa  239  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.42 
 
 
515 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  34.42 
 
 
510 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  36.08 
 
 
514 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  35.38 
 
 
496 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  36.08 
 
 
514 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
504 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.9 
 
 
509 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  36.08 
 
 
514 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  36.08 
 
 
514 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6197  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.76 
 
 
514 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.327318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  35.59 
 
 
513 aa  238  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2365  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.9 
 
 
509 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.316959  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  36.08 
 
 
514 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  35.89 
 
 
502 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  34.45 
 
 
510 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  34.51 
 
 
515 aa  236  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  33.86 
 
 
508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.68 
 
 
487 aa  236  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  36.24 
 
 
507 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  34.04 
 
 
515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.24 
 
 
510 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  34.51 
 
 
510 aa  234  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  33.85 
 
 
515 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  34.17 
 
 
515 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  34.17 
 
 
515 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.5 
 
 
490 aa  232  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  33.27 
 
 
504 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>