More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1617 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
514 aa  1013    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.11 
 
 
510 aa  326  5e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.49 
 
 
515 aa  300  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.31 
 
 
525 aa  281  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.53 
 
 
533 aa  280  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.8 
 
 
524 aa  280  6e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.77 
 
 
500 aa  279  7e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.5 
 
 
524 aa  279  8e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.16 
 
 
498 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  33.92 
 
 
514 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.99 
 
 
521 aa  276  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.84 
 
 
516 aa  272  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  32.25 
 
 
517 aa  270  7e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.33 
 
 
514 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  31.21 
 
 
524 aa  260  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.88 
 
 
511 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.19 
 
 
520 aa  256  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.44 
 
 
518 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.62 
 
 
524 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.76 
 
 
509 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
492 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  32.94 
 
 
530 aa  247  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.58 
 
 
521 aa  246  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  31.08 
 
 
519 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.73 
 
 
513 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.73 
 
 
519 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.97 
 
 
532 aa  242  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  32.38 
 
 
512 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.37 
 
 
516 aa  240  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.81 
 
 
530 aa  236  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  31.24 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.76 
 
 
519 aa  233  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.08 
 
 
512 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.83 
 
 
517 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.52 
 
 
533 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.25 
 
 
524 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.84 
 
 
528 aa  223  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.54 
 
 
533 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  33.4 
 
 
488 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.55 
 
 
490 aa  219  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.17 
 
 
501 aa  219  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  30.77 
 
 
499 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.18 
 
 
506 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  33.4 
 
 
486 aa  216  7e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.39 
 
 
493 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  29.67 
 
 
499 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  31.09 
 
 
515 aa  213  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  30.74 
 
 
490 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.87 
 
 
504 aa  211  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  30.42 
 
 
512 aa  209  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.69 
 
 
521 aa  209  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31 
 
 
523 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  31.43 
 
 
499 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.14 
 
 
518 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  29.55 
 
 
513 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.63 
 
 
524 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  30.43 
 
 
522 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.17 
 
 
514 aa  204  3e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.11 
 
 
556 aa  204  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  33.41 
 
 
463 aa  204  4e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  30.56 
 
 
498 aa  203  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.17 
 
 
504 aa  203  6e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  34.21 
 
 
466 aa  201  3e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.23 
 
 
556 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  30.15 
 
 
499 aa  199  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  29.75 
 
 
508 aa  199  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.54 
 
 
502 aa  197  3e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.32 
 
 
512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.87 
 
 
515 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  28.98 
 
 
524 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.07 
 
 
529 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.61 
 
 
492 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.99 
 
 
523 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.2 
 
 
496 aa  195  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  29.85 
 
 
507 aa  194  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.02 
 
 
487 aa  194  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.84 
 
 
504 aa  193  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0069  hypothetical protein  29.57 
 
 
504 aa  192  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.5 
 
 
511 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.05 
 
 
490 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  29.24 
 
 
506 aa  192  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  31.45 
 
 
499 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  28.78 
 
 
496 aa  192  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  30.48 
 
 
496 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.25 
 
 
546 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.21 
 
 
479 aa  190  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.45 
 
 
501 aa  190  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.42 
 
 
494 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.42 
 
 
494 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  28.03 
 
 
511 aa  188  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.83 
 
 
492 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.27 
 
 
512 aa  187  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.8 
 
 
527 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.54 
 
 
513 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.97 
 
 
542 aa  184  3e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  27.54 
 
 
504 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  27.35 
 
 
504 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  30.75 
 
 
436 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  28.77 
 
 
493 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.96 
 
 
567 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>