More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1453 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 501 aa  1025    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.59 
 
 		 493 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  42.4 
 
 		 511 aa  431  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  44.69 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6197  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.62 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.327318 
 
 
-
 
NC_002950  PG0069  hypothetical protein  41.63 
 
 		 504 aa  375  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.08 
 
 		 487 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.95 
 
 		 514 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.16 
 
 		 525 aa  279  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.05 
 
 		 520 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.24 
 
 		 521 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.63 
 
 		 524 aa  273  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  35.62 
 
 		 514 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.35 
 
 		 515 aa  267  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.2 
 
 		 533 aa  262  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 517 aa  262  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  35.42 
 
 		 519 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.63 
 
 		 530 aa  259  8e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.35 
 
 		 516 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.01 
 
 		 517 aa  257  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 		 519 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  29.76 
 
 		 499 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  33.78 
 
 		 530 aa  242  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  32.89 
 
 		 522 aa  240  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.5 
 
 		 521 aa  239  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.36 
 
 		 524 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.81 
 
 		 510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 		 524 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.3 
 
 		 509 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  28.95 
 
 		 499 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.22 
 
 		 521 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.42 
 
 		 524 aa  232  1e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.13 
 
 		 492 aa  229  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2563  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.96 
 
 		 281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  30.35 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.79 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.73 
 
 		 513 aa  221  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.36 
 
 		 533 aa  219  8.999999999999998e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.09 
 
 		 511 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.67 
 
 		 515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  31.19 
 
 		 498 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  30.98 
 
 		 512 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.32 
 
 		 532 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0510  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.86 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0209732  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  32.77 
 
 		 462 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.28 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.88 
 
 		 502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.69 
 
 		 519 aa  200  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.63 
 
 		 504 aa  199  9e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  32.27 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.5 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.33 
 
 		 528 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.14 
 
 		 498 aa  195  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  32.4 
 
 		 508 aa  195  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.21 
 
 		 499 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.08 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.35 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  32.21 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  32.67 
 
 		 512 aa  193  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.03 
 
 		 492 aa  193  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  32.19 
 
 		 496 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  32.1 
 
 		 506 aa  193  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  35.28 
 
 		 436 aa  192  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.1 
 
 		 531 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.48 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.94 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.87 
 
 		 511 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.9 
 
 		 490 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  32.64 
 
 		 512 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  30.94 
 
 		 504 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  30.18 
 
 		 513 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  30.74 
 
 		 504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  29.8 
 
 		 510 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  30.94 
 
 		 504 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  30.86 
 
 		 514 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.99 
 
 		 518 aa  190  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  29.94 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  31.52 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.49 
 
 		 531 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  30.86 
 
 		 514 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  30.71 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  30.86 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  30.86 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  30.86 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.56 
 
 		 514 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.91 
 
 		 512 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  29.27 
 
 		 510 aa  186  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  30.74 
 
 		 514 aa  186  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  30.69 
 
 		 496 aa  186  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  27.25 
 
 		 524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  29.6 
 
 		 515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.19 
 
 		 515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  31.41 
 
 		 493 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  29.6 
 
 		 515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.46 
 
 		 488 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  31.19 
 
 		 510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.61 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.65 
 
 		 499 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.54 
 
 		 494 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.47 
 
 		 496 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>