More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0802 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  100 
 
 		 507 aa  965    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.51 
 
 		 519 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  40.31 
 
 		 514 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.88 
 
 		 514 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.19 
 
 		 517 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.18 
 
 		 521 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.91 
 
 		 521 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.47 
 
 		 520 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39 
 
 		 533 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38 
 
 		 513 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.12 
 
 		 524 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  35.06 
 
 		 517 aa  269  8.999999999999999e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.77 
 
 		 530 aa  268  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.21 
 
 		 524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.49 
 
 		 524 aa  267  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.08 
 
 		 515 aa  267  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  43.06 
 
 		 497 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.44 
 
 		 510 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 524 aa  263  8e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.86 
 
 		 528 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.92 
 
 		 490 aa  261  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.23 
 
 		 498 aa  260  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.31 
 
 		 513 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.47 
 
 		 532 aa  256  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.89 
 
 		 494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.03 
 
 		 500 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.14 
 
 		 525 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  38.54 
 
 		 519 aa  250  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.42 
 
 		 530 aa  247  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.87 
 
 		 501 aa  246  8e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.38 
 
 		 495 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.72 
 
 		 509 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  39.76 
 
 		 490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.11 
 
 		 479 aa  243  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.3 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.17 
 
 		 518 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.83 
 
 		 516 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.81 
 
 		 521 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.85 
 
 		 504 aa  233  4.0000000000000004e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.68 
 
 		 511 aa  230  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.85 
 
 		 514 aa  229  7e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  36.43 
 
 		 501 aa  229  9e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  36.43 
 
 		 501 aa  229  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.59 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.28 
 
 		 512 aa  227  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  37.14 
 
 		 499 aa  225  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  32.13 
 
 		 513 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.06 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.57 
 
 		 501 aa  224  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  32.75 
 
 		 512 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.03 
 
 		 501 aa  223  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  37.35 
 
 		 499 aa  223  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.11 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  32.09 
 
 		 524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.89 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.42 
 
 		 507 aa  220  5e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  37.2 
 
 		 493 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  37.74 
 
 		 499 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  36.69 
 
 		 514 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  36.69 
 
 		 514 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  36.69 
 
 		 514 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  36.69 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  36.69 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  36.77 
 
 		 522 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.72 
 
 		 533 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  28.19 
 
 		 499 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.43 
 
 		 504 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.38 
 
 		 533 aa  216  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.98 
 
 		 515 aa  216  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.21 
 
 		 508 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  34.98 
 
 		 510 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  34.78 
 
 		 510 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  34.78 
 
 		 515 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.28 
 
 		 556 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.63 
 
 		 514 aa  216  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  34.98 
 
 		 515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  34.98 
 
 		 515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  34.98 
 
 		 515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  34.98 
 
 		 515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.88 
 
 		 519 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.06 
 
 		 496 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  34.78 
 
 		 510 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.17 
 
 		 556 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  28.13 
 
 		 499 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.35 
 
 		 511 aa  213  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.63 
 
 		 510 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  34.1 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.23 
 
 		 516 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.95 
 
 		 546 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.6 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.53 
 
 		 499 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  34.9 
 
 		 496 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.84 
 
 		 515 aa  211  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  36.1 
 
 		 499 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.56 
 
 		 490 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  34.79 
 
 		 486 aa  210  5e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  34.59 
 
 		 488 aa  210  6e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  36 
 
 		 500 aa  209  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  44.47 
 
 		 533 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.28 
 
 		 485 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>