More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1793 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
501 aa  991    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.73 
 
 
504 aa  425  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.98 
 
 
500 aa  382  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.77 
 
 
498 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.76 
 
 
515 aa  286  7e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.04 
 
 
510 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.94 
 
 
490 aa  277  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.42 
 
 
521 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.88 
 
 
524 aa  270  5e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  34.58 
 
 
530 aa  269  8.999999999999999e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.15 
 
 
532 aa  269  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.05 
 
 
511 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  31.9 
 
 
524 aa  267  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.63 
 
 
525 aa  267  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.88 
 
 
517 aa  266  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.91 
 
 
519 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.87 
 
 
524 aa  263  8e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 
509 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.42 
 
 
524 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.25 
 
 
533 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  32.81 
 
 
499 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.88 
 
 
530 aa  252  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  32.16 
 
 
517 aa  252  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.24 
 
 
519 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.08 
 
 
513 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.65 
 
 
516 aa  246  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.59 
 
 
521 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  31.42 
 
 
498 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.38 
 
 
528 aa  243  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.1 
 
 
524 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.45 
 
 
518 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  32.06 
 
 
519 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  32.16 
 
 
499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.7 
 
 
533 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.23 
 
 
506 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.63 
 
 
520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.55 
 
 
512 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.77 
 
 
514 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  30.88 
 
 
514 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.53 
 
 
515 aa  232  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.27 
 
 
492 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.58 
 
 
533 aa  230  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.21 
 
 
514 aa  227  3e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.45 
 
 
516 aa  225  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.82 
 
 
504 aa  225  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.2 
 
 
502 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.93 
 
 
521 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.16 
 
 
542 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.21 
 
 
462 aa  220  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.2 
 
 
494 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.94 
 
 
501 aa  218  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31 
 
 
494 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.27 
 
 
498 aa  216  5.9999999999999996e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0354907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.86 
 
 
494 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.92 
 
 
507 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  31.98 
 
 
486 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.94 
 
 
494 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  31.24 
 
 
522 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  31.57 
 
 
488 aa  215  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  32.02 
 
 
499 aa  211  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.67 
 
 
514 aa  208  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.07 
 
 
493 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.45 
 
 
523 aa  206  9e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.74 
 
 
499 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.74 
 
 
499 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.76 
 
 
479 aa  204  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  31.54 
 
 
499 aa  203  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  30.87 
 
 
507 aa  203  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  29.66 
 
 
496 aa  202  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.98 
 
 
499 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1502  hypothetical protein  33.99 
 
 
509 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16359  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  30.27 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  31.36 
 
 
436 aa  201  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  30 
 
 
504 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.65 
 
 
508 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.68 
 
 
528 aa  200  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  29.59 
 
 
511 aa  200  6e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  29.8 
 
 
504 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.79 
 
 
499 aa  199  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  29.61 
 
 
504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.34 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0699  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
504 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2365  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.31 
 
 
509 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.316959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.31 
 
 
509 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.35 
 
 
530 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.99 
 
 
490 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.11 
 
 
499 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.21 
 
 
502 aa  196  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2660  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.96 
 
 
513 aa  194  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00741118  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.57 
 
 
529 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  30.66 
 
 
500 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0995  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.33 
 
 
531 aa  194  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.31 
 
 
496 aa  194  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.91 
 
 
492 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1020  YjeF-related protein-like  29.43 
 
 
525 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0522551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.45 
 
 
492 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  30.65 
 
 
481 aa  190  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  29.12 
 
 
510 aa  190  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  30.3 
 
 
512 aa  189  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  29.33 
 
 
510 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>