More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2696 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
515 aa  1033    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.98 
 
 
516 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  43.73 
 
 
517 aa  445  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  46.8 
 
 
514 aa  435  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.19 
 
 
519 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  44.87 
 
 
530 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.68 
 
 
525 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.21 
 
 
521 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.41 
 
 
510 aa  413  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  44.87 
 
 
519 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.79 
 
 
524 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.08 
 
 
520 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.39 
 
 
530 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.02 
 
 
514 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.78 
 
 
517 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.63 
 
 
533 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.83 
 
 
521 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.92 
 
 
532 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.27 
 
 
521 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  39.26 
 
 
524 aa  365  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.72 
 
 
524 aa  359  7e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.29 
 
 
533 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.73 
 
 
513 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.75 
 
 
498 aa  347  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.86 
 
 
500 aa  342  9e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.93 
 
 
524 aa  341  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  36.61 
 
 
499 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  36.99 
 
 
499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.65 
 
 
533 aa  335  9e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.87 
 
 
511 aa  332  8e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.94 
 
 
492 aa  332  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.55 
 
 
524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.49 
 
 
519 aa  316  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.61 
 
 
509 aa  316  7e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  38.58 
 
 
522 aa  310  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.57 
 
 
493 aa  300  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.53 
 
 
511 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.24 
 
 
528 aa  296  5e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.84 
 
 
518 aa  291  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.49 
 
 
514 aa  290  6e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.76 
 
 
501 aa  286  7e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  35.55 
 
 
512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.31 
 
 
516 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.97 
 
 
515 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  36 
 
 
512 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.35 
 
 
513 aa  274  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  35.63 
 
 
499 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.48 
 
 
504 aa  271  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  34.58 
 
 
498 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.81 
 
 
506 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.1 
 
 
567 aa  266  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.69 
 
 
502 aa  264  3e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.8 
 
 
512 aa  264  4e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6197  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.45 
 
 
514 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.327318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1502  hypothetical protein  38.94 
 
 
509 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16359  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.3 
 
 
479 aa  256  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.07 
 
 
501 aa  254  3e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.05 
 
 
504 aa  254  3e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
487 aa  253  5.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  34.04 
 
 
511 aa  252  9.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.53 
 
 
514 aa  252  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  34.22 
 
 
512 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.35 
 
 
501 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 
507 aa  247  3e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.72 
 
 
509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.12 
 
 
500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.99 
 
 
546 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  33.65 
 
 
522 aa  243  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2365  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.82 
 
 
509 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.316959  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.51 
 
 
490 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.98 
 
 
556 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.54 
 
 
529 aa  240  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0069  hypothetical protein  32.62 
 
 
504 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.69 
 
 
508 aa  236  7e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.12 
 
 
499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.99 
 
 
520 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  33.08 
 
 
507 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.09 
 
 
556 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  33.21 
 
 
513 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  32.41 
 
 
488 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  32.6 
 
 
486 aa  232  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  34.64 
 
 
500 aa  231  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  35.23 
 
 
508 aa  229  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.37 
 
 
515 aa  229  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  35.37 
 
 
510 aa  229  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.59 
 
 
542 aa  229  9e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  33.8 
 
 
503 aa  229  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  35.37 
 
 
515 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  34.79 
 
 
510 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  35.37 
 
 
515 aa  229  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  35.37 
 
 
515 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  35.37 
 
 
515 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  35.37 
 
 
515 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  33.69 
 
 
462 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  33.91 
 
 
506 aa  228  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.87 
 
 
518 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  34.12 
 
 
493 aa  226  8e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  34.13 
 
 
493 aa  226  9e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  35.15 
 
 
510 aa  226  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  33.74 
 
 
514 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>