More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3063 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 508 aa  1025    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  51.99 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.15 
 
 		 539 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  52.19 
 
 		 499 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  51.59 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  50.8 
 
 		 499 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.33 
 
 		 510 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  51.4 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  50.4 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.5 
 
 		 501 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.7 
 
 		 522 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  47.21 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.93 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  47.21 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.44 
 
 		 538 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.3 
 
 		 496 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.6 
 
 		 499 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.78 
 
 		 485 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  46.3 
 
 		 493 aa  360  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.51 
 
 		 500 aa  348  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.99 
 
 		 496 aa  347  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.05 
 
 		 500 aa  342  8e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.53 
 
 		 490 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.84 
 
 		 490 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.76 
 
 		 468 aa  332  9e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1547  hypothetical protein  51.29 
 
 		 526 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.7 
 
 		 507 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.75 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.61 
 
 		 507 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.41 
 
 		 507 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  40.42 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  38.32 
 
 		 466 aa  296  7e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  43.21 
 
 		 523 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.25 
 
 		 492 aa  294  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  40.26 
 
 		 528 aa  292  8e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.8 
 
 		 476 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  39.31 
 
 		 581 aa  283  8.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4460  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.27 
 
 		 509 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  36.54 
 
 		 514 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.6 
 
 		 457 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.69 
 
 		 515 aa  242  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.69 
 
 		 525 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.53 
 
 		 514 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.19 
 
 		 513 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.48 
 
 		 530 aa  230  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.1 
 
 		 528 aa  229  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.73 
 
 		 521 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.92 
 
 		 520 aa  228  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  34.95 
 
 		 519 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.74 
 
 		 533 aa  224  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  35.74 
 
 		 517 aa  224  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.84 
 
 		 524 aa  223  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.12 
 
 		 500 aa  220  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.22 
 
 		 521 aa  220  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.77 
 
 		 479 aa  219  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.25 
 
 		 498 aa  219  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.31 
 
 		 531 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.16 
 
 		 510 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.15 
 
 		 524 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.3 
 
 		 519 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.83 
 
 		 500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.31 
 
 		 531 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.94 
 
 		 519 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.37 
 
 		 524 aa  211  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  31.93 
 
 		 498 aa  210  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.66 
 
 		 504 aa  207  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.53 
 
 		 501 aa  207  5e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  34.7 
 
 		 530 aa  206  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.5 
 
 		 509 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.23 
 
 		 490 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  31.66 
 
 		 508 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.48 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.86 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  33.33 
 
 		 524 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.11 
 
 		 511 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.63 
 
 		 556 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  33.88 
 
 		 515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.66 
 
 		 523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  33.14 
 
 		 515 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  33.14 
 
 		 515 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.48 
 
 		 515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  35.34 
 
 		 496 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.15 
 
 		 524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.79 
 
 		 517 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.75 
 
 		 515 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  33.88 
 
 		 515 aa  197  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.42 
 
 		 512 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  35.34 
 
 		 502 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  35.02 
 
 		 531 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  32.75 
 
 		 510 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.16 
 
 		 502 aa  196  8.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  32.89 
 
 		 522 aa  196  9e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  32.94 
 
 		 510 aa  196  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.99 
 
 		 492 aa  196  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.83 
 
 		 533 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.76 
 
 		 533 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.01 
 
 		 529 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.08 
 
 		 490 aa  195  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  33.68 
 
 		 510 aa  195  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  33.47 
 
 		 515 aa  193  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>