More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2379 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  100 
 
 
506 aa  1016    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.24 
 
 
513 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  50.2 
 
 
487 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  49.89 
 
 
522 aa  385  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  51.43 
 
 
482 aa  355  7.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  46.12 
 
 
526 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  46.89 
 
 
535 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.17 
 
 
529 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.53 
 
 
531 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.42 
 
 
531 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  43.81 
 
 
533 aa  299  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  46.6 
 
 
514 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  43.11 
 
 
531 aa  286  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  45.89 
 
 
531 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  45.89 
 
 
531 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.45 
 
 
530 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  45.89 
 
 
531 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  45.89 
 
 
531 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  45.89 
 
 
531 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  45.89 
 
 
531 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  45.69 
 
 
531 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1358  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.65 
 
 
514 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624281  normal  0.973105 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  46.35 
 
 
514 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.35 
 
 
514 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.64 
 
 
514 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.45 
 
 
514 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  37.52 
 
 
498 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  39.88 
 
 
510 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  41.96 
 
 
436 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  40.28 
 
 
515 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  42.8 
 
 
462 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  42.94 
 
 
503 aa  263  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  39.56 
 
 
510 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2133  carbohydrate kinase, putative  45.78 
 
 
531 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.56 
 
 
515 aa  263  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  39.56 
 
 
510 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  39.76 
 
 
515 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  39.76 
 
 
515 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  41.72 
 
 
514 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  39.56 
 
 
515 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  41.48 
 
 
513 aa  261  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  39.56 
 
 
515 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  39.6 
 
 
514 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  39.6 
 
 
514 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  39.6 
 
 
514 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  39.6 
 
 
514 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.05 
 
 
514 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  39.41 
 
 
514 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  41.43 
 
 
510 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.45 
 
 
490 aa  256  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  38.84 
 
 
508 aa  256  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  39.52 
 
 
504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  39.32 
 
 
504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  39.52 
 
 
504 aa  254  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.34 
 
 
499 aa  253  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  35.91 
 
 
517 aa  250  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.35 
 
 
504 aa  250  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  37.25 
 
 
512 aa  249  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  37.27 
 
 
493 aa  249  9e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  36.87 
 
 
493 aa  249  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2596  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.19 
 
 
486 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  40.92 
 
 
502 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.35 
 
 
502 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.05 
 
 
499 aa  239  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  37.92 
 
 
496 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.29 
 
 
509 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  38.21 
 
 
494 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  40.32 
 
 
502 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.96 
 
 
510 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.05 
 
 
499 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  38.74 
 
 
500 aa  233  8.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  37.75 
 
 
490 aa  232  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.64 
 
 
499 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  35.65 
 
 
513 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.33 
 
 
524 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  37.85 
 
 
488 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  36.83 
 
 
514 aa  230  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.45 
 
 
499 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  40.31 
 
 
500 aa  229  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.91 
 
 
492 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  38.05 
 
 
486 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.8 
 
 
533 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  33.73 
 
 
492 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.26 
 
 
515 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.25 
 
 
499 aa  228  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1982  hypothetical protein  42.3 
 
 
510 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0776556 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  34.65 
 
 
499 aa  226  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.16 
 
 
513 aa  226  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.26 
 
 
494 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.97 
 
 
520 aa  225  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.66 
 
 
494 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  35.73 
 
 
524 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.66 
 
 
494 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.86 
 
 
494 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.98 
 
 
519 aa  224  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.2 
 
 
521 aa  224  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  34.94 
 
 
519 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.37 
 
 
494 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.27 
 
 
521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.28 
 
 
517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>