More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3022 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  92.2 
 
 
514 aa  917    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
520 aa  1015    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.28 
 
 
521 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  58.67 
 
 
514 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  59.57 
 
 
519 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53 
 
 
525 aa  532  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.05 
 
 
524 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.78 
 
 
533 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.08 
 
 
515 aa  405  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.87 
 
 
521 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.33 
 
 
530 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.21 
 
 
519 aa  359  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.72 
 
 
517 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  40.19 
 
 
517 aa  351  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.91 
 
 
510 aa  348  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  42.86 
 
 
530 aa  346  7e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  41.84 
 
 
524 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.42 
 
 
524 aa  342  8e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.89 
 
 
524 aa  340  4e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.13 
 
 
516 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.11 
 
 
532 aa  326  5e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.93 
 
 
492 aa  317  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.41 
 
 
519 aa  317  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.54 
 
 
521 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.89 
 
 
500 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  34.81 
 
 
499 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.92 
 
 
533 aa  310  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.69 
 
 
524 aa  310  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.51 
 
 
498 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  39.77 
 
 
522 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  34.75 
 
 
499 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.46 
 
 
513 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.51 
 
 
509 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.84 
 
 
511 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.76 
 
 
511 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  36.29 
 
 
499 aa  288  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.56 
 
 
528 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.69 
 
 
493 aa  286  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.53 
 
 
533 aa  284  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.03 
 
 
506 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.26 
 
 
513 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.64 
 
 
499 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  35.32 
 
 
498 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.59 
 
 
518 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.05 
 
 
501 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  36.85 
 
 
496 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.72 
 
 
556 aa  259  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6197  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.23 
 
 
514 aa  259  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.327318 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  36.08 
 
 
512 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.7 
 
 
479 aa  258  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  36.17 
 
 
512 aa  256  5e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.5 
 
 
504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.19 
 
 
514 aa  253  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  32.02 
 
 
511 aa  252  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  35.7 
 
 
512 aa  249  9e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  39.01 
 
 
502 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0069  hypothetical protein  34.04 
 
 
504 aa  247  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  40.47 
 
 
507 aa  247  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.71 
 
 
516 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.4 
 
 
492 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  38.31 
 
 
502 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.38 
 
 
490 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.56 
 
 
556 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  36.59 
 
 
486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.63 
 
 
501 aa  243  6e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  36.18 
 
 
488 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  34.67 
 
 
510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.67 
 
 
515 aa  240  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  34.47 
 
 
510 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  34.4 
 
 
515 aa  240  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  34.67 
 
 
510 aa  240  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  39.61 
 
 
495 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  34.4 
 
 
515 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  34.47 
 
 
515 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  34.47 
 
 
515 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.61 
 
 
515 aa  239  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  37.33 
 
 
499 aa  237  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2365  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.25 
 
 
509 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.316959  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  34.27 
 
 
515 aa  237  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  33.98 
 
 
513 aa  237  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  37.2 
 
 
500 aa  236  7e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.76 
 
 
496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.96 
 
 
510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.49 
 
 
509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.47 
 
 
499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.92 
 
 
500 aa  234  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  35.4 
 
 
514 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  35.4 
 
 
514 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  34.59 
 
 
508 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  35.4 
 
 
514 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  40.44 
 
 
436 aa  233  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  35.4 
 
 
514 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.55 
 
 
567 aa  233  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  35.4 
 
 
514 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.67 
 
 
512 aa  232  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  36.86 
 
 
503 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1502  hypothetical protein  42.14 
 
 
509 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  37.05 
 
 
499 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  37.25 
 
 
496 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  31.49 
 
 
490 aa  226  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>