More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0567 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  87.7 
 
 
496 aa  837    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  970    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  68.27 
 
 
499 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  71.49 
 
 
499 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  64.84 
 
 
502 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  68.88 
 
 
500 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  64.63 
 
 
502 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  45.09 
 
 
498 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.17 
 
 
490 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  52.07 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  62.29 
 
 
307 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  43.56 
 
 
488 aa  355  1e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  62.29 
 
 
307 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  65.44 
 
 
286 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  43.56 
 
 
486 aa  351  2e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  65.81 
 
 
286 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.07 
 
 
492 aa  344  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  45.2 
 
 
500 aa  344  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.86 
 
 
520 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.25 
 
 
502 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  48.42 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  46.19 
 
 
462 aa  333  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.1 
 
 
499 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.64 
 
 
496 aa  329  8e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  46.42 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.97 
 
 
504 aa  326  7e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  42.05 
 
 
504 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  42.25 
 
 
504 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  42.25 
 
 
504 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  41.77 
 
 
513 aa  322  7e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  43.16 
 
 
510 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  42.6 
 
 
512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  41.21 
 
 
510 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  42.74 
 
 
510 aa  320  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.74 
 
 
515 aa  319  6e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  42.52 
 
 
515 aa  319  9e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  42.52 
 
 
515 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  42.52 
 
 
515 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  42.52 
 
 
515 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  42.52 
 
 
515 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  41.99 
 
 
514 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  41.99 
 
 
514 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  41.99 
 
 
514 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  41.99 
 
 
514 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  41.99 
 
 
514 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  40.92 
 
 
514 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  40.45 
 
 
508 aa  312  7.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  41.16 
 
 
510 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.06 
 
 
494 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  40.8 
 
 
494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  42.56 
 
 
503 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  43.12 
 
 
495 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.65 
 
 
494 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.57 
 
 
494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.45 
 
 
494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  41.95 
 
 
492 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.96 
 
 
492 aa  301  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.53 
 
 
499 aa  299  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  37.92 
 
 
492 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.93 
 
 
499 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.73 
 
 
499 aa  293  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.6 
 
 
499 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  40.96 
 
 
499 aa  290  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  39.92 
 
 
493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  39.92 
 
 
496 aa  289  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  40.52 
 
 
513 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  39.51 
 
 
493 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  38.68 
 
 
490 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.99 
 
 
494 aa  281  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.15 
 
 
488 aa  279  9e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  35.47 
 
 
524 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0671  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.83 
 
 
509 aa  261  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.91 
 
 
509 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.36 
 
 
520 aa  256  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.92 
 
 
525 aa  256  9e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.04 
 
 
492 aa  246  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.75 
 
 
504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.57 
 
 
514 aa  243  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.05 
 
 
520 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  37.19 
 
 
522 aa  240  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.74 
 
 
510 aa  236  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.14 
 
 
521 aa  236  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.62 
 
 
524 aa  234  3e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  36.13 
 
 
514 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  34.11 
 
 
517 aa  233  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  35.51 
 
 
522 aa  232  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  37.36 
 
 
506 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.13 
 
 
559 aa  232  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  28.92 
 
 
499 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.42 
 
 
519 aa  229  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.51 
 
 
515 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  38.76 
 
 
482 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.75 
 
 
524 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  28.26 
 
 
499 aa  226  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0520  hypothetical protein  34.42 
 
 
586 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.75104  decreased coverage  0.0023767 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.91 
 
 
513 aa  223  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.92 
 
 
521 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.33 
 
 
511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.29 
 
 
530 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.37 
 
 
533 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>