More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0598 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  100 
 
 		 499 aa  1006    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  82.36 
 
 		 499 aa  833    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  78.96 
 
 		 494 aa  792    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  79.36 
 
 		 494 aa  792    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  78.96 
 
 		 494 aa  791    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  91.18 
 
 		 499 aa  924    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  90.38 
 
 		 499 aa  914    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  90.38 
 
 		 499 aa  917    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  78.96 
 
 		 494 aa  788    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  64.27 
 
 		 496 aa  632  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  61.37 
 
 		 492 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  60.82 
 
 		 492 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.78 
 
 		 488 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  60 
 
 		 492 aa  555  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.57 
 
 		 502 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  44.86 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  44.86 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  44.66 
 
 		 504 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  44.75 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  45.15 
 
 		 514 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  44.95 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  45.15 
 
 		 514 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  45.15 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  45.15 
 
 		 514 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  45.35 
 
 		 514 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  44.55 
 
 		 515 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  44.55 
 
 		 515 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  44.36 
 
 		 510 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  44.36 
 
 		 515 aa  365  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.36 
 
 		 515 aa  364  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  44.36 
 
 		 515 aa  364  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  44.36 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  44.09 
 
 		 514 aa  363  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  44.36 
 
 		 515 aa  363  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  47.87 
 
 		 462 aa  362  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  47.19 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  42.57 
 
 		 498 aa  360  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  45.38 
 
 		 503 aa  355  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  46.99 
 
 		 486 aa  355  8.999999999999999e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  43.96 
 
 		 510 aa  351  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  41.68 
 
 		 512 aa  350  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  44.29 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  40.47 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.9 
 
 		 499 aa  333  5e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  44.55 
 
 		 500 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  41.28 
 
 		 494 aa  329  7e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  47.66 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.34 
 
 		 504 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.47 
 
 		 490 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  40.19 
 
 		 524 aa  312  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  41.45 
 
 		 502 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  40.77 
 
 		 496 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  36.97 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  40.76 
 
 		 493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  40.4 
 
 		 493 aa  286  7e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.45 
 
 		 492 aa  286  7e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.26 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  40.73 
 
 		 496 aa  282  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  41.73 
 
 		 502 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  43.05 
 
 		 499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  40.44 
 
 		 496 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  41.62 
 
 		 500 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  41.61 
 
 		 496 aa  264  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.51 
 
 		 494 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.4 
 
 		 496 aa  257  4e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.46 
 
 		 520 aa  256  7e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  42.14 
 
 		 495 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.43 
 
 		 520 aa  253  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  33.87 
 
 		 499 aa  249  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  33.49 
 
 		 499 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.39 
 
 		 509 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.7 
 
 		 504 aa  230  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  36.92 
 
 		 522 aa  226  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  33.53 
 
 		 517 aa  226  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.78 
 
 		 519 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.83 
 
 		 529 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.61 
 
 		 498 aa  223  7e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.96 
 
 		 530 aa  222  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.41 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0671  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.33 
 
 		 509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  34.65 
 
 		 506 aa  219  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.65 
 
 		 531 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  35.99 
 
 		 526 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.87 
 
 		 510 aa  213  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.59 
 
 		 517 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  36.87 
 
 		 531 aa  210  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.39 
 
 		 515 aa  210  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.03 
 
 		 506 aa  209  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.37 
 
 		 524 aa  209  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  35.97 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  30.14 
 
 		 511 aa  208  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.71 
 
 		 531 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.41 
 
 		 307 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.28 
 
 		 516 aa  207  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.94 
 
 		 493 aa  206  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.33 
 
 		 519 aa  206  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.43 
 
 		 521 aa  206  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 		 516 aa  206  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.12 
 
 		 524 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.52 
 
 		 532 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>