More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0491 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
504 aa  967    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  42.83 
 
 
498 aa  356  5e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.58 
 
 
490 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  47.96 
 
 
436 aa  316  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  45.29 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  40.8 
 
 
510 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  37.37 
 
 
490 aa  301  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  41.25 
 
 
488 aa  300  3e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  43.45 
 
 
462 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  41.16 
 
 
515 aa  300  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  40.8 
 
 
515 aa  300  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  40.8 
 
 
515 aa  300  5e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  40.8 
 
 
510 aa  300  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.2 
 
 
515 aa  299  9e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  41.37 
 
 
515 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  41.16 
 
 
510 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  41.37 
 
 
515 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  41.25 
 
 
486 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  40 
 
 
514 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  40 
 
 
514 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  40 
 
 
514 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  40 
 
 
514 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  40 
 
 
514 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.69 
 
 
494 aa  293  6e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.44 
 
 
499 aa  289  9e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.41 
 
 
492 aa  289  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  44.49 
 
 
502 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.58 
 
 
494 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  39.96 
 
 
504 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  39.96 
 
 
504 aa  287  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.43 
 
 
496 aa  286  5e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  39.76 
 
 
504 aa  286  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  39.8 
 
 
493 aa  286  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  45.68 
 
 
496 aa  286  7e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  39.6 
 
 
493 aa  286  8e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.7 
 
 
494 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.17 
 
 
494 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  40.98 
 
 
514 aa  282  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  43.72 
 
 
495 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.53 
 
 
502 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  35.36 
 
 
513 aa  280  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.17 
 
 
494 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  39.6 
 
 
508 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  36.78 
 
 
512 aa  279  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  44.31 
 
 
502 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  35.57 
 
 
524 aa  276  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  39.88 
 
 
510 aa  274  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  39.96 
 
 
503 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  41.58 
 
 
496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.78 
 
 
499 aa  267  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  38.43 
 
 
494 aa  266  8e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  40.96 
 
 
513 aa  262  8.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.49 
 
 
492 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  38.7 
 
 
499 aa  259  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.55 
 
 
499 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.35 
 
 
520 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  38.98 
 
 
500 aa  254  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  42.51 
 
 
496 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.48 
 
 
504 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  39.2 
 
 
496 aa  252  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.85 
 
 
499 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  39.22 
 
 
492 aa  249  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.73 
 
 
499 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.38 
 
 
488 aa  247  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  44.42 
 
 
500 aa  246  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.73 
 
 
499 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.08 
 
 
520 aa  242  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  35.84 
 
 
517 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  41.46 
 
 
499 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.51 
 
 
492 aa  239  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  38.52 
 
 
492 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0671  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.02 
 
 
509 aa  236  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.45 
 
 
519 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.13 
 
 
510 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.72 
 
 
509 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  38.42 
 
 
522 aa  224  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.7 
 
 
531 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.49 
 
 
511 aa  223  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  37.7 
 
 
506 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  40.24 
 
 
531 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.9 
 
 
533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.49 
 
 
531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.71 
 
 
524 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.8 
 
 
520 aa  213  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.64 
 
 
521 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.94 
 
 
504 aa  210  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.51 
 
 
529 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.11 
 
 
500 aa  209  8e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.25 
 
 
514 aa  209  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.13 
 
 
479 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.71 
 
 
518 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  37.33 
 
 
530 aa  207  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  29.29 
 
 
499 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.86 
 
 
514 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.3 
 
 
515 aa  205  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.15 
 
 
511 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  34.98 
 
 
512 aa  203  5e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.67 
 
 
524 aa  202  8e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  39.54 
 
 
482 aa  203  8e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.36 
 
 
286 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>