More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00644 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
499 aa  1022    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51 
 
 
504 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.06 
 
 
502 aa  408  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  43.81 
 
 
512 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  43.33 
 
 
513 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.54 
 
 
515 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  44.58 
 
 
514 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  42.54 
 
 
510 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  44.58 
 
 
514 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  44.58 
 
 
514 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  42.34 
 
 
515 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  44.58 
 
 
514 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  44.58 
 
 
514 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  42.54 
 
 
515 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  44.09 
 
 
504 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  42.14 
 
 
515 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  42.34 
 
 
510 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  42.14 
 
 
515 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  42.34 
 
 
510 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  43.89 
 
 
504 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  42.14 
 
 
515 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  44.49 
 
 
503 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  43.89 
 
 
504 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  43.39 
 
 
514 aa  375  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  42.42 
 
 
508 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  43.33 
 
 
510 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  41.45 
 
 
498 aa  360  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.09 
 
 
490 aa  359  6e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  42.86 
 
 
513 aa  355  7.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.86 
 
 
492 aa  351  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.63 
 
 
499 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.54 
 
 
499 aa  350  4e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  41.87 
 
 
492 aa  350  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  41.13 
 
 
494 aa  345  7e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.72 
 
 
499 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  43.44 
 
 
462 aa  341  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.2 
 
 
494 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  41.1 
 
 
496 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.2 
 
 
494 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41 
 
 
494 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  41.9 
 
 
499 aa  333  5e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41 
 
 
494 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  40.6 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  41.98 
 
 
492 aa  325  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  45.93 
 
 
436 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.64 
 
 
499 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  40.69 
 
 
488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.71 
 
 
488 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.6 
 
 
499 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.52 
 
 
492 aa  320  5e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  40.69 
 
 
486 aa  318  2e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  39.22 
 
 
490 aa  317  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  43.26 
 
 
502 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  43.99 
 
 
499 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  40.7 
 
 
496 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  42.25 
 
 
502 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  38.14 
 
 
524 aa  306  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  42.29 
 
 
500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  40.36 
 
 
493 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.16 
 
 
520 aa  292  8e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  39.84 
 
 
493 aa  292  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  38.65 
 
 
500 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  40.45 
 
 
495 aa  286  9e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  42.04 
 
 
496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  40.52 
 
 
496 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.7 
 
 
496 aa  280  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.46 
 
 
494 aa  269  8e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.32 
 
 
520 aa  266  8e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0671  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.32 
 
 
509 aa  256  7e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  34.95 
 
 
522 aa  250  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 
510 aa  250  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.24 
 
 
531 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.7 
 
 
533 aa  242  9e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.88 
 
 
513 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 
509 aa  240  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  33.2 
 
 
517 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  35.05 
 
 
506 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.77 
 
 
531 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.26 
 
 
498 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.24 
 
 
514 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  35.6 
 
 
514 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  35.95 
 
 
530 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.06 
 
 
500 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  35.2 
 
 
522 aa  229  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.82 
 
 
521 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.25 
 
 
520 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.33 
 
 
529 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.55 
 
 
504 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.22 
 
 
519 aa  226  9e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.34 
 
 
521 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.44 
 
 
513 aa  224  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.79 
 
 
515 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.81 
 
 
524 aa  223  6e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.07 
 
 
479 aa  223  7e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  30.31 
 
 
499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.1 
 
 
532 aa  221  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 
524 aa  220  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.07 
 
 
511 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  36.22 
 
 
487 aa  219  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  31.21 
 
 
499 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>