More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4175 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
488 aa  984    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  66.8 
 
 
492 aa  669    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  59.1 
 
 
492 aa  565  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  58.78 
 
 
499 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  59.06 
 
 
499 aa  566  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.57 
 
 
499 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  60.08 
 
 
492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.78 
 
 
499 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.16 
 
 
499 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  59.05 
 
 
494 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  59.05 
 
 
494 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.85 
 
 
494 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  58.85 
 
 
494 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  57.03 
 
 
496 aa  530  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.24 
 
 
502 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  42.36 
 
 
504 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  42.16 
 
 
504 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  42.36 
 
 
504 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  41.38 
 
 
498 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  42.07 
 
 
508 aa  352  7e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  45.22 
 
 
462 aa  351  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  41.34 
 
 
515 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  41.34 
 
 
515 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  41.34 
 
 
510 aa  340  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  41.14 
 
 
510 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  41.14 
 
 
515 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  41.92 
 
 
503 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.94 
 
 
515 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  41.14 
 
 
515 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  40.94 
 
 
510 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  40.94 
 
 
514 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  40.73 
 
 
515 aa  334  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  40.94 
 
 
514 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  40.94 
 
 
514 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  40.94 
 
 
514 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  40.94 
 
 
514 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  40.89 
 
 
514 aa  333  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  40.85 
 
 
510 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  43.44 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.71 
 
 
499 aa  320  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  38.61 
 
 
512 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  43.65 
 
 
486 aa  317  4e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  40.7 
 
 
513 aa  316  7e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.42 
 
 
490 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  38.94 
 
 
524 aa  309  6.999999999999999e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  44.75 
 
 
436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  37.38 
 
 
513 aa  303  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  37.88 
 
 
494 aa  302  8.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.6 
 
 
504 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  39.96 
 
 
500 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.37 
 
 
492 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  37.83 
 
 
502 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  37.75 
 
 
496 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  40 
 
 
496 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  38.26 
 
 
500 aa  266  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  38.45 
 
 
493 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  38.65 
 
 
493 aa  264  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  39.02 
 
 
496 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.03 
 
 
499 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  38.03 
 
 
502 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  33.26 
 
 
490 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  37.2 
 
 
495 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  39.02 
 
 
499 aa  247  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 
509 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  39.83 
 
 
496 aa  243  5e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.83 
 
 
496 aa  242  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.58 
 
 
521 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.44 
 
 
494 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.12 
 
 
520 aa  226  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.47 
 
 
520 aa  226  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0671  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.75 
 
 
509 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.74 
 
 
529 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.73 
 
 
531 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.38 
 
 
504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  30.46 
 
 
499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.53 
 
 
492 aa  213  7.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.27 
 
 
524 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.06 
 
 
510 aa  210  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  35.8 
 
 
531 aa  209  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.15 
 
 
506 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.83 
 
 
531 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  30.69 
 
 
499 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  34.51 
 
 
506 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  35.82 
 
 
522 aa  207  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  32.35 
 
 
517 aa  204  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  30.57 
 
 
511 aa  203  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  36.1 
 
 
526 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.87 
 
 
516 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
530 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  36.41 
 
 
512 aa  200  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.04 
 
 
286 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.86 
 
 
307 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.2 
 
 
307 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  35.45 
 
 
535 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.4 
 
 
530 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.84 
 
 
286 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  33.66 
 
 
531 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  33.66 
 
 
531 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  33.66 
 
 
531 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>