More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1878 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1042    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  66.54 
 
 		 526 aa  631  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  53.41 
 
 		 531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  54.22 
 
 		 531 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  53.63 
 
 		 531 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.51 
 
 		 529 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  45.82 
 
 		 533 aa  346  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  49.9 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  49.9 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  49.9 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  49.9 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  49.9 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  49.9 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  49.71 
 
 		 531 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  46.89 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  50.97 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.97 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  51.65 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1358  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.93 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624281  normal  0.973105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2133  carbohydrate kinase, putative  49.51 
 
 		 531 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217143  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.16 
 
 		 530 aa  323  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.16 
 
 		 514 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.93 
 
 		 514 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.13 
 
 		 514 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  43.86 
 
 		 522 aa  293  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.19 
 
 		 513 aa  292  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  45.17 
 
 		 487 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2596  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.18 
 
 		 486 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.08 
 
 		 517 aa  277  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1426  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.45 
 
 		 514 aa  272  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2854  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.82 
 
 		 548 aa  266  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.212974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1984  hypothetical protein  45.87 
 
 		 487 aa  259  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2698  hypothetical protein  44.38 
 
 		 523 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.13 
 
 		 490 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1982  hypothetical protein  45.63 
 
 		 510 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776556 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  40.29 
 
 		 508 aa  246  9e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  46.33 
 
 		 482 aa  244  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  42.26 
 
 		 503 aa  240  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  38.57 
 
 		 510 aa  240  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  38.93 
 
 		 510 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  38.49 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.29 
 
 		 515 aa  237  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  38.73 
 
 		 515 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  38.1 
 
 		 515 aa  236  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  38.73 
 
 		 515 aa  236  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  38.73 
 
 		 515 aa  236  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  36.35 
 
 		 490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  38.73 
 
 		 515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.03 
 
 		 502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  34.81 
 
 		 512 aa  233  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.4 
 
 		 499 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.36 
 
 		 519 aa  232  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  39.41 
 
 		 504 aa  231  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  39.2 
 
 		 504 aa  230  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  39.41 
 
 		 504 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  35.76 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  34.68 
 
 		 513 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  39.65 
 
 		 514 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  39.8 
 
 		 510 aa  226  8e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.89 
 
 		 494 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  38.64 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  38.64 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  38.64 
 
 		 514 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  35.76 
 
 		 486 aa  225  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  38.64 
 
 		 514 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  38.64 
 
 		 514 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.6 
 
 		 509 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  40.93 
 
 		 502 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  39.91 
 
 		 436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  34.38 
 
 		 498 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.7 
 
 		 494 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.79 
 
 		 504 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  34.59 
 
 		 524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.5 
 
 		 492 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.59 
 
 		 513 aa  221  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.4 
 
 		 492 aa  220  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2588  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.22 
 
 		 508 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.236021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1220  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.22 
 
 		 505 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.42 
 
 		 494 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  39.67 
 
 		 462 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.92 
 
 		 494 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.5 
 
 		 499 aa  217  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  36.67 
 
 		 493 aa  217  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  34.5 
 
 		 492 aa  216  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.59 
 
 		 499 aa  216  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  39.19 
 
 		 496 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.53 
 
 		 510 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.17 
 
 		 515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.54 
 
 		 499 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  39.03 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.29 
 
 		 533 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.66 
 
 		 499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  35.83 
 
 		 493 aa  214  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.54 
 
 		 499 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  40.39 
 
 		 500 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  33.74 
 
 		 494 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  35.48 
 
 		 499 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1821  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.85 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  39.42 
 
 		 499 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.45 
 
 		 488 aa  211  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>