More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00413 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  100 
 
 
495 aa  952    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  65.52 
 
 
496 aa  529  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  65.88 
 
 
496 aa  529  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  62.35 
 
 
494 aa  490  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  45.55 
 
 
498 aa  371  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  48.05 
 
 
502 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.61 
 
 
492 aa  353  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.44 
 
 
515 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  46.36 
 
 
510 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.1 
 
 
490 aa  349  6e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  45.62 
 
 
515 aa  349  8e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  44.62 
 
 
508 aa  348  9e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  45.44 
 
 
510 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  45.62 
 
 
515 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  49.18 
 
 
502 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  46.23 
 
 
515 aa  347  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.22 
 
 
499 aa  347  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  46.15 
 
 
515 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  46.15 
 
 
515 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  44.69 
 
 
510 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  43.98 
 
 
514 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  43.78 
 
 
514 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  43.98 
 
 
514 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  43.98 
 
 
514 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  43.98 
 
 
514 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  43.9 
 
 
496 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  46.63 
 
 
488 aa  332  8e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.1 
 
 
502 aa  332  8e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  46.71 
 
 
499 aa  329  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  46.63 
 
 
486 aa  329  9e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  46.5 
 
 
510 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  45.26 
 
 
462 aa  322  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  48.76 
 
 
436 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  44.95 
 
 
514 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  43.43 
 
 
500 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  47.23 
 
 
496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  41.27 
 
 
512 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.06 
 
 
499 aa  315  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  43.12 
 
 
496 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  41.92 
 
 
504 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  41.92 
 
 
504 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  43.79 
 
 
503 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  41.72 
 
 
504 aa  312  7.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.23 
 
 
504 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  47.78 
 
 
500 aa  309  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.12 
 
 
499 aa  309  9e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.82 
 
 
492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.14 
 
 
499 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.44 
 
 
494 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.94 
 
 
499 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.56 
 
 
494 aa  302  9e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  38.88 
 
 
513 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.68 
 
 
494 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.24 
 
 
494 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  39.07 
 
 
492 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.12 
 
 
499 aa  297  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  42.14 
 
 
499 aa  294  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  41.3 
 
 
494 aa  292  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  42.89 
 
 
513 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  41.19 
 
 
493 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.38 
 
 
520 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  40.78 
 
 
493 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  39.04 
 
 
490 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.8 
 
 
504 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  40.32 
 
 
496 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.2 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.56 
 
 
514 aa  273  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  39.96 
 
 
492 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.61 
 
 
520 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.25 
 
 
521 aa  263  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  40.12 
 
 
514 aa  259  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.48 
 
 
533 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0671  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.55 
 
 
509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  36.2 
 
 
524 aa  242  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.56 
 
 
531 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.54 
 
 
530 aa  242  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.52 
 
 
509 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.47 
 
 
520 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.42 
 
 
525 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.83 
 
 
531 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  39.71 
 
 
506 aa  236  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.96 
 
 
513 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  34.39 
 
 
517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.13 
 
 
515 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50 
 
 
307 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.69 
 
 
519 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  37.4 
 
 
519 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  52.12 
 
 
286 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  36.57 
 
 
524 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  38.57 
 
 
530 aa  230  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  36.98 
 
 
522 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
510 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.84 
 
 
524 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.65 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.74 
 
 
524 aa  226  7e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.47 
 
 
517 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.02 
 
 
524 aa  226  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  29.02 
 
 
499 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  40.32 
 
 
531 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  29.85 
 
 
499 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>