More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4752 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  81.64 
 
 
515 aa  855    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  82.03 
 
 
515 aa  860    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  82.12 
 
 
510 aa  856    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1028    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  82.12 
 
 
510 aa  855    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  81.64 
 
 
515 aa  855    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  99.81 
 
 
514 aa  1026    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  99.61 
 
 
514 aa  1025    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  66 
 
 
513 aa  634    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  99.61 
 
 
514 aa  1024    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  82.12 
 
 
510 aa  854    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  82.03 
 
 
515 aa  860    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  82.03 
 
 
515 aa  859    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  99.81 
 
 
514 aa  1026    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  81.64 
 
 
515 aa  857    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  79.05 
 
 
508 aa  814    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  61.6 
 
 
504 aa  624  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  61.4 
 
 
504 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  67.46 
 
 
462 aa  621  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  61.2 
 
 
504 aa  622  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  63.02 
 
 
514 aa  621  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  62.8 
 
 
510 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  64.19 
 
 
503 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  46.22 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.85 
 
 
502 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.58 
 
 
499 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  42.97 
 
 
513 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  45.15 
 
 
499 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.86 
 
 
490 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.8 
 
 
494 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.75 
 
 
504 aa  369  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.77 
 
 
499 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.6 
 
 
494 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.6 
 
 
494 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.6 
 
 
494 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.11 
 
 
492 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.38 
 
 
499 aa  363  6e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  44.22 
 
 
496 aa  361  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.38 
 
 
499 aa  361  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  43.58 
 
 
498 aa  360  5e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.38 
 
 
499 aa  359  7e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  42.38 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  42.14 
 
 
492 aa  342  8e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  39.85 
 
 
524 aa  338  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  45.44 
 
 
502 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.94 
 
 
488 aa  334  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.2 
 
 
499 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  45.03 
 
 
502 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  44.58 
 
 
488 aa  326  6e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  42.54 
 
 
492 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  42.94 
 
 
500 aa  323  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  44.38 
 
 
486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  44.61 
 
 
496 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  38.48 
 
 
490 aa  319  7e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  42.45 
 
 
496 aa  319  9e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.4 
 
 
496 aa  316  5e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.89 
 
 
492 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  45.36 
 
 
496 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.49 
 
 
520 aa  312  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.75 
 
 
494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  47.27 
 
 
436 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  40.98 
 
 
493 aa  302  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  41.25 
 
 
493 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  41.06 
 
 
496 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  43.52 
 
 
500 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  43.57 
 
 
495 aa  298  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  42.89 
 
 
499 aa  287  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.35 
 
 
520 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40 
 
 
504 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  40.84 
 
 
506 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.43 
 
 
529 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.41 
 
 
492 aa  240  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.72 
 
 
531 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.47 
 
 
533 aa  236  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  38.52 
 
 
526 aa  236  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  37.02 
 
 
522 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.74 
 
 
504 aa  235  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.08 
 
 
524 aa  232  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0671  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.7 
 
 
509 aa  231  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.73 
 
 
519 aa  230  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  36.73 
 
 
514 aa  229  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  37.35 
 
 
533 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.72 
 
 
531 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  34.29 
 
 
517 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.94 
 
 
493 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.2 
 
 
521 aa  226  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.18 
 
 
513 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.6 
 
 
510 aa  225  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  39.62 
 
 
487 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 
521 aa  224  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.54 
 
 
515 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.4 
 
 
520 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.73 
 
 
525 aa  223  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  37.36 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.93 
 
 
509 aa  220  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  34.04 
 
 
519 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.56 
 
 
517 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.92 
 
 
511 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.8 
 
 
514 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  38.64 
 
 
535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>