More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1954 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
509 aa  1042    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  70.89 
 
 
506 aa  712    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.09 
 
 
510 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40 
 
 
525 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.61 
 
 
515 aa  316  7e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.5 
 
 
513 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.67 
 
 
521 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.29 
 
 
519 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.34 
 
 
533 aa  309  8e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  38.69 
 
 
514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.03 
 
 
521 aa  309  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  36.71 
 
 
517 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.64 
 
 
524 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.51 
 
 
514 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.42 
 
 
511 aa  293  7e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.51 
 
 
520 aa  292  9e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.58 
 
 
517 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.58 
 
 
524 aa  288  1e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.83 
 
 
530 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.79 
 
 
498 aa  286  9e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.62 
 
 
516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  37.5 
 
 
519 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.28 
 
 
500 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.85 
 
 
524 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.44 
 
 
533 aa  282  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.2 
 
 
519 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  37.38 
 
 
530 aa  277  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.38 
 
 
502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.02 
 
 
521 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  36.78 
 
 
522 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.53 
 
 
499 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  35.29 
 
 
498 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  37.35 
 
 
488 aa  270  5.9999999999999995e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  37.55 
 
 
486 aa  269  7e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  33.07 
 
 
499 aa  269  8e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.26 
 
 
532 aa  269  8.999999999999999e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.95 
 
 
524 aa  269  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  32.82 
 
 
524 aa  267  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  36.98 
 
 
492 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.46 
 
 
501 aa  261  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.88 
 
 
490 aa  260  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.93 
 
 
533 aa  257  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  38.19 
 
 
492 aa  256  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  35.32 
 
 
512 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  34.85 
 
 
502 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  32.49 
 
 
499 aa  253  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  35.85 
 
 
502 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.51 
 
 
487 aa  250  5e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  34.72 
 
 
496 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.76 
 
 
512 aa  249  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.71 
 
 
492 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.8 
 
 
502 aa  248  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  35.41 
 
 
490 aa  247  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.89 
 
 
516 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  32.11 
 
 
524 aa  246  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  34.41 
 
 
512 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 
488 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  35.52 
 
 
496 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  35.91 
 
 
494 aa  244  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.95 
 
 
507 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  36.26 
 
 
436 aa  242  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  31.01 
 
 
511 aa  242  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  34.08 
 
 
512 aa  241  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.44 
 
 
528 aa  241  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0069  hypothetical protein  32.62 
 
 
504 aa  240  4e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.66 
 
 
499 aa  240  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.53 
 
 
511 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  34.8 
 
 
493 aa  240  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.69 
 
 
492 aa  239  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  35.4 
 
 
493 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  34.29 
 
 
506 aa  237  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.79 
 
 
530 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  34.43 
 
 
504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.93 
 
 
499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.15 
 
 
514 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.93 
 
 
499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.34 
 
 
499 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.38 
 
 
513 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  34.21 
 
 
504 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  33.14 
 
 
513 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  33.2 
 
 
510 aa  233  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  33.73 
 
 
508 aa  233  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34 
 
 
493 aa  233  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  34.21 
 
 
504 aa  233  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34 
 
 
518 aa  232  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.18 
 
 
504 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.8 
 
 
494 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  33.4 
 
 
515 aa  231  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  35.39 
 
 
499 aa  230  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.19 
 
 
494 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  34.01 
 
 
522 aa  229  8e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.2 
 
 
515 aa  229  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  33.2 
 
 
510 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  33.2 
 
 
515 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.94 
 
 
504 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  33.2 
 
 
515 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  33.2 
 
 
515 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  33.2 
 
 
510 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  32.99 
 
 
515 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  34.26 
 
 
499 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>