More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0626 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  932    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  51.43 
 
 
506 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  52.42 
 
 
487 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.22 
 
 
513 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  46.54 
 
 
522 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.28 
 
 
531 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  45.97 
 
 
526 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.87 
 
 
490 aa  272  9e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.07 
 
 
531 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  45.83 
 
 
535 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  45.55 
 
 
531 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.5 
 
 
529 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  37.85 
 
 
498 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  46.01 
 
 
531 aa  256  9e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  46.01 
 
 
531 aa  256  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  46.01 
 
 
531 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  46.01 
 
 
531 aa  256  9e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  46.01 
 
 
531 aa  256  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  45.7 
 
 
531 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.22 
 
 
499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  46.01 
 
 
531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  43.63 
 
 
502 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1020  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.65 
 
 
530 aa  246  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  39.41 
 
 
510 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  38.53 
 
 
510 aa  243  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  38.38 
 
 
496 aa  243  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  43.44 
 
 
502 aa  242  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  38.78 
 
 
515 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  40.32 
 
 
504 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  38.78 
 
 
515 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  43.46 
 
 
500 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  39.32 
 
 
515 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  40.09 
 
 
504 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  38.53 
 
 
515 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  38.53 
 
 
515 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.32 
 
 
515 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  39.32 
 
 
510 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  40.32 
 
 
504 aa  240  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.19 
 
 
502 aa  239  8e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.18 
 
 
499 aa  239  8e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.97 
 
 
499 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  35 
 
 
512 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  37.18 
 
 
494 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  41.59 
 
 
462 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  42.24 
 
 
436 aa  236  8e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.52 
 
 
513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.59 
 
 
509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2133  carbohydrate kinase, putative  45.01 
 
 
531 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  40.55 
 
 
500 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6163  hypothetical protein  47.52 
 
 
514 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  38.36 
 
 
508 aa  235  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1916  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.52 
 
 
514 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.194731  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.53 
 
 
492 aa  234  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  40.69 
 
 
496 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  38.45 
 
 
514 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  41.79 
 
 
533 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  38.45 
 
 
514 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  38.45 
 
 
514 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  38.45 
 
 
514 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  38.45 
 
 
514 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.63 
 
 
494 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.42 
 
 
494 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  38.38 
 
 
492 aa  231  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.42 
 
 
494 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.47 
 
 
517 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.85 
 
 
494 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  38.43 
 
 
514 aa  229  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.68 
 
 
499 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.34 
 
 
499 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1939  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.02 
 
 
514 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643573  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  38.32 
 
 
514 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  34.45 
 
 
492 aa  226  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  35.57 
 
 
490 aa  226  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  39.69 
 
 
503 aa  226  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  42.08 
 
 
499 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.26 
 
 
499 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1358  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.5 
 
 
514 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.624281  normal  0.973105 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.76 
 
 
514 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  39.65 
 
 
519 aa  223  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  37.82 
 
 
488 aa  222  9e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  33.4 
 
 
517 aa  222  9e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  36.71 
 
 
499 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5217  hypothetical protein  44.74 
 
 
514 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  35.24 
 
 
524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.19 
 
 
530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  36.83 
 
 
493 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1834  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.02 
 
 
514 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  38.03 
 
 
486 aa  219  7e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.28 
 
 
504 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  36.62 
 
 
493 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.54 
 
 
510 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.56 
 
 
524 aa  218  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.18 
 
 
488 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.41 
 
 
521 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.79 
 
 
525 aa  216  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  33.88 
 
 
513 aa  216  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  39.83 
 
 
496 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.58 
 
 
519 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.48 
 
 
520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.93 
 
 
521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>