More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0461 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 528 aa  1034    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.64 
 
 		 530 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  37.19 
 
 		 517 aa  323  6e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.8 
 
 		 519 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.71 
 
 		 517 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  42.34 
 
 		 530 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.89 
 
 		 510 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.12 
 
 		 532 aa  317  4e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.24 
 
 		 525 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.04 
 
 		 521 aa  312  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.7 
 
 		 524 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.24 
 
 		 515 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.27 
 
 		 533 aa  299  7e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  39.88 
 
 		 514 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  38.31 
 
 		 524 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  40.15 
 
 		 519 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.12 
 
 		 521 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.1 
 
 		 514 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.7 
 
 		 513 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.56 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.77 
 
 		 524 aa  278  2e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.65 
 
 		 492 aa  263  6e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.71 
 
 		 498 aa  260  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.59 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.23 
 
 		 521 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.4 
 
 		 524 aa  256  9e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.98 
 
 		 533 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.57 
 
 		 519 aa  255  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.38 
 
 		 501 aa  248  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.02 
 
 		 524 aa  248  1e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.24 
 
 		 556 aa  246  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  29.45 
 
 		 499 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  35.74 
 
 		 498 aa  242  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  36.71 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.95 
 
 		 516 aa  241  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.2 
 
 		 556 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.25 
 
 		 490 aa  236  6e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.78 
 
 		 504 aa  236  7e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  35.59 
 
 		 512 aa  231  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  28.46 
 
 		 499 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.9 
 
 		 530 aa  230  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.9 
 
 		 501 aa  229  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  34.03 
 
 		 508 aa  229  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.6 
 
 		 518 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0995  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.13 
 
 		 531 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.98 
 
 		 490 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  34.27 
 
 		 512 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.68 
 
 		 567 aa  226  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.93 
 
 		 509 aa  226  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.33 
 
 		 507 aa  226  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.89 
 
 		 511 aa  226  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  38.86 
 
 		 507 aa  226  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.4 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  36.85 
 
 		 499 aa  223  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.02 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.33 
 
 		 512 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1090  YjeF-related protein-like  35.26 
 
 		 526 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.393825  normal  0.597478 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.6 
 
 		 527 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.84 
 
 		 514 aa  219  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.54 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  37 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.54 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.52 
 
 		 515 aa  217  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.64 
 
 		 523 aa  217  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  33.84 
 
 		 500 aa  216  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  34.64 
 
 		 515 aa  216  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.85 
 
 		 522 aa  216  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.9 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.85 
 
 		 511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  36.38 
 
 		 510 aa  213  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.06 
 
 		 528 aa  213  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.38 
 
 		 510 aa  212  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.38 
 
 		 516 aa  211  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  32.13 
 
 		 511 aa  210  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  34.03 
 
 		 501 aa  210  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  34.03 
 
 		 501 aa  210  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.88 
 
 		 513 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.33 
 
 		 504 aa  209  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.19 
 
 		 492 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.74 
 
 		 493 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.88 
 
 		 546 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  36.53 
 
 		 499 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  34.99 
 
 		 488 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.73 
 
 		 514 aa  206  6e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  32.11 
 
 		 499 aa  206  7e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  35.35 
 
 		 499 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  31.35 
 
 		 512 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  35.85 
 
 		 499 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.62 
 
 		 539 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1020  YjeF-related protein-like  34.88 
 
 		 525 aa  204  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0522551  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  34.99 
 
 		 486 aa  203  6e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.14 
 
 		 487 aa  203  7e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.31 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  32.58 
 
 		 510 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.77 
 
 		 523 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  36.2 
 
 		 493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.84 
 
 		 490 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.2 
 
 		 507 aa  201  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  36.6 
 
 		 519 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.02 
 
 		 490 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>