More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1065 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 487 aa  1004    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  41.96 
 
 		 511 aa  401  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.02 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.08 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  41.46 
 
 		 499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_002950  PG0069  hypothetical protein  39.76 
 
 		 504 aa  330  4e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6197  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.32 
 
 		 514 aa  322  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.327318 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  35.31 
 
 		 517 aa  263  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  34.37 
 
 		 499 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.05 
 
 		 492 aa  256  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 515 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.15 
 
 		 533 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.51 
 
 		 509 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2563  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.57 
 
 		 281 aa  250  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  33.33 
 
 		 499 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.33 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.84 
 
 		 525 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.79 
 
 		 521 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.24 
 
 		 515 aa  233  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.27 
 
 		 513 aa  233  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.01 
 
 		 524 aa  231  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.1 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.7 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.35 
 
 		 530 aa  231  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.41 
 
 		 519 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  35.17 
 
 		 522 aa  230  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.68 
 
 		 524 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  35.53 
 
 		 530 aa  228  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.8 
 
 		 511 aa  227  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  32.48 
 
 		 514 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  33.13 
 
 		 488 aa  223  9e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  32.93 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  33.13 
 
 		 486 aa  219  7e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.94 
 
 		 490 aa  219  8.999999999999998e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.13 
 
 		 521 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.27 
 
 		 514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  30.43 
 
 		 519 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.85 
 
 		 506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.42 
 
 		 521 aa  213  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.85 
 
 		 498 aa  212  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.56 
 
 		 520 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.85 
 
 		 500 aa  211  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.94 
 
 		 494 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.14 
 
 		 494 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.14 
 
 		 494 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.25 
 
 		 524 aa  207  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  29.31 
 
 		 524 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.94 
 
 		 494 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.65 
 
 		 502 aa  203  7e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.56 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.63 
 
 		 504 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.94 
 
 		 532 aa  199  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.37 
 
 		 524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  30.38 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.14 
 
 		 528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.57 
 
 		 492 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.06 
 
 		 519 aa  196  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.5 
 
 		 499 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.17 
 
 		 499 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.17 
 
 		 499 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.83 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 496 aa  194  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.06 
 
 		 499 aa  194  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.06 
 
 		 518 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.11 
 
 		 533 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.12 
 
 		 496 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.66 
 
 		 516 aa  190  5e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.6 
 
 		 499 aa  189  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.06 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  30.22 
 
 		 514 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  31.98 
 
 		 504 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  29.44 
 
 		 496 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  31.05 
 
 		 492 aa  187  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  31.59 
 
 		 502 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.19 
 
 		 511 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  31.78 
 
 		 504 aa  186  9e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  30.3 
 
 		 510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.98 
 
 		 501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  29.47 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.18 
 
 		 504 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  31.85 
 
 		 499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  31.78 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  30.35 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  30.55 
 
 		 515 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  30.8 
 
 		 515 aa  183  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  30.55 
 
 		 510 aa  183  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  30.8 
 
 		 515 aa  183  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  30.55 
 
 		 515 aa  183  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  30.39 
 
 		 515 aa  182  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.6 
 
 		 515 aa  182  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  28.46 
 
 		 524 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  30.6 
 
 		 510 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  31.6 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.43 
 
 		 499 aa  181  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.02 
 
 		 514 aa  181  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  30.67 
 
 		 462 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  31.69 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  32.04 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  29.78 
 
 		 508 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>